More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 335 aa  642    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  44.26 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  43.67 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  48.33 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  41.14 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  37.86 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  40.85 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  43.14 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  38.83 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  43.2 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  42.43 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  42.71 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  40.92 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  44.27 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  35.03 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  39.35 
 
 		 326 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  40.59 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.16 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.79 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.79 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.9 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  40.91 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.32 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.98 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  36.07 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.1 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  31.33 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.77 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.41 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.62 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.96 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  38.36 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  35.06 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  32.24 
 
 		 400 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.85 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.3 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.13 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  35.48 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.59 
 
 		 317 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  29.38 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  34.95 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  27.24 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  35.37 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  33.02 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  36.94 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.89 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  38.43 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  36.25 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  34.29 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.01 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  33.23 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  33.23 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  33.23 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  33.23 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  33.23 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  33.23 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  33.23 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  33.23 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  33.23 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.97 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  34.69 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  29.15 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.8 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.8 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.43 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  37.18 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  32.91 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  35.37 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  34.72 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  30.28 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  32.17 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  36.81 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  24.75 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  36.16 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  33.87 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.83 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  37.82 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  36.54 
 
 		 314 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  32.33 
 
 		 297 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  32.26 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.6 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1094  ROK family protein  31.6 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000124678  hitchhiker  0.000000000129961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  36.46 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.74 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  32.7 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  30.4 
 
 		 410 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.39 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.95 
 
 		 408 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  31.21 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  37.61 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.47 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.73 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.22 
 
 		 396 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  29.22 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  34.52 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  32.03 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  40 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  34.53 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  35.38 
 
 		 387 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>