More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5341 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  100 
 
 
404 aa  779    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  53.66 
 
 
401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  48.04 
 
 
387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  44.39 
 
 
400 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  43.93 
 
 
393 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  46.51 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  43.75 
 
 
396 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  42.86 
 
 
420 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  37.56 
 
 
402 aa  270  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  43.56 
 
 
418 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  42.93 
 
 
389 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  43.3 
 
 
396 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  40.49 
 
 
422 aa  265  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  41.51 
 
 
401 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  41.28 
 
 
429 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  41.67 
 
 
396 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  43.19 
 
 
395 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  40.85 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  33.8 
 
 
389 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  39.01 
 
 
395 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  38.08 
 
 
402 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.98 
 
 
414 aa  205  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  34.13 
 
 
409 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  36.59 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  37.08 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  32.22 
 
 
397 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  39.51 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  38.15 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  31.09 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  36.14 
 
 
503 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  39.53 
 
 
403 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  36.48 
 
 
428 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  35.64 
 
 
406 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  30.5 
 
 
410 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  37.96 
 
 
410 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  36.96 
 
 
443 aa  189  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  31.09 
 
 
399 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  35.22 
 
 
418 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  33.76 
 
 
395 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  38.52 
 
 
399 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  36.63 
 
 
395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  34.73 
 
 
420 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  30.83 
 
 
400 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  35.97 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.61 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  35.42 
 
 
392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  32.9 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  37.43 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  30.67 
 
 
404 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  31.25 
 
 
427 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  30.4 
 
 
399 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  34.6 
 
 
395 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.17 
 
 
383 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  30.13 
 
 
400 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  34.01 
 
 
386 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  36.65 
 
 
393 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  33.51 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  35.6 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  30.43 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  36.29 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  39.17 
 
 
392 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  32.89 
 
 
398 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  39.55 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.92 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.92 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.2 
 
 
347 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  37.27 
 
 
401 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.82 
 
 
396 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.37 
 
 
315 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  32.87 
 
 
425 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  33.23 
 
 
425 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  31.87 
 
 
397 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  30.77 
 
 
410 aa  159  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  32.62 
 
 
425 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  36.56 
 
 
392 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  37.85 
 
 
405 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  36.43 
 
 
390 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.53 
 
 
322 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  34.11 
 
 
414 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.65 
 
 
408 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  35.62 
 
 
420 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  35.86 
 
 
389 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  32.4 
 
 
405 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  33.9 
 
 
407 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  28.14 
 
 
402 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  34.53 
 
 
414 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  33.52 
 
 
405 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.36 
 
 
408 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  33.52 
 
 
395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.98 
 
 
364 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  31.23 
 
 
381 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  35.1 
 
 
392 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  39.61 
 
 
427 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  29.82 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30 
 
 
417 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  29.82 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  29.82 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  29.82 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  29.82 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  29.82 
 
 
406 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>