More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4206 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  100 
 
 
395 aa  772    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  62.44 
 
 
392 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  61.6 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  51.53 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  44.19 
 
 
389 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  43.62 
 
 
395 aa  292  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  41.54 
 
 
402 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  39.74 
 
 
410 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  39.21 
 
 
406 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  40.74 
 
 
395 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  41.13 
 
 
503 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  37.89 
 
 
395 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  39.47 
 
 
392 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  43.77 
 
 
392 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  38.8 
 
 
405 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  37.73 
 
 
427 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  38.27 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  37.14 
 
 
403 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  36.62 
 
 
405 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  38.67 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  36.24 
 
 
390 aa  196  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  35.31 
 
 
372 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  32.65 
 
 
420 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  35.36 
 
 
384 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  32.72 
 
 
389 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  33.97 
 
 
408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  30.38 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.86 
 
 
401 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  31.4 
 
 
372 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  32.11 
 
 
381 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.34 
 
 
391 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.94 
 
 
408 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  33.6 
 
 
409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  34.44 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  31.11 
 
 
381 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33.15 
 
 
389 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  32.5 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  33.42 
 
 
429 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.56 
 
 
410 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.79 
 
 
402 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.49 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.52 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.96 
 
 
434 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.52 
 
 
428 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.23 
 
 
401 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.56 
 
 
425 aa  143  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  32.08 
 
 
393 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  34.04 
 
 
393 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  32.49 
 
 
397 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  26.26 
 
 
416 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  34.81 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.85 
 
 
414 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.39 
 
 
401 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  31.48 
 
 
396 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.09 
 
 
409 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.12 
 
 
405 aa  136  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  31.09 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.19 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.93 
 
 
422 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  30.03 
 
 
455 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  31.88 
 
 
429 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  30.27 
 
 
402 aa  133  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  32.96 
 
 
420 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  23.58 
 
 
388 aa  132  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  30.3 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.27 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.57 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  31.49 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  26.4 
 
 
404 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  26.77 
 
 
385 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.11 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.93 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  32.62 
 
 
425 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.46 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  25.39 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.52 
 
 
396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  33.23 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.1 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1908  ROK family protein  27.89 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.477922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  31.37 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  33.53 
 
 
396 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  32.02 
 
 
410 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.92 
 
 
400 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.2 
 
 
404 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.79 
 
 
391 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.07 
 
 
410 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.77 
 
 
407 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.19 
 
 
327 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.19 
 
 
327 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  30.68 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
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NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.15 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  22.8 
 
 
364 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.88 
 
 
327 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.88 
 
 
327 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.88 
 
 
327 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.88 
 
 
327 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.88 
 
 
327 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.88 
 
 
327 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.88 
 
 
327 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  32.25 
 
 
390 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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