More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3063 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  100 
 
 		 392 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  41.13 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  39.47 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  37.74 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  36.39 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  38.16 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  35.68 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  35.86 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  36.36 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  35.36 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  35.09 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  34.75 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  31.15 
 
 		 389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  31.33 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  34.21 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  33.77 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  32.46 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  33.77 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  33.25 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.3 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  31.33 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.25 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.05 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  32.35 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  33.7 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  27.01 
 
 		 407 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  31.14 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  30.69 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.68 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.9 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  32.28 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  34.99 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  30.38 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.25 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  34.44 
 
 		 387 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.42 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  40.15 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  25.87 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  25.85 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.27 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  25.13 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.6 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  31.64 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.32 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.76 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  31.17 
 
 		 429 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.65 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  32.45 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  33.69 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  24.87 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  22.34 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.25 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  26.46 
 
 		 410 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.53 
 
 		 398 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.28 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  29.26 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  33.25 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.97 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  32.48 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.42 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.48 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  31.99 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.98 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.67 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25.9 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25.9 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  25.84 
 
 		 364 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  25.9 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  23.24 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25.9 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25.9 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  25.06 
 
 		 406 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25.9 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25.9 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  23.24 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25.9 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25.9 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  23.24 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  23.24 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  25.06 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  25.06 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  30.1 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  23.24 
 
 		 406 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  23.24 
 
 		 406 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  23.24 
 
 		 406 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  23.24 
 
 		 406 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  23.24 
 
 		 406 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.08 
 
 		 410 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.3 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  24.65 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  25.06 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  31.19 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.81 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  24.35 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.56 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.56 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  33.93 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>