More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2468 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  100 
 
 		 395 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  60.48 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  57.56 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  54.76 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  56.07 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  54.59 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  54.33 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  58.79 
 
 		 405 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  52.76 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  48.42 
 
 		 390 aa  335  7e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  48.95 
 
 		 392 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  48.31 
 
 		 420 aa  315  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  45.14 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  45.83 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  42.15 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  42.67 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  45.17 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  40.1 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  44.35 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  42.61 
 
 		 409 aa  258  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  38.54 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  37.89 
 
 		 395 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  41.9 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  39.88 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  39.48 
 
 		 392 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  36.68 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  42.04 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  38.06 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  36.7 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  36.41 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  36.8 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  36.07 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  38.84 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  31.23 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  32.97 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31 
 
 		 391 aa  193  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  38.2 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  36.55 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.59 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32.97 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  32.97 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  36.15 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  36.63 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  33.33 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  33.97 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.87 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  33.33 
 
 		 429 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  33.86 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  35.07 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  36.16 
 
 		 420 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  35.18 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.97 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.33 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.12 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.49 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.34 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.12 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.02 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  31.02 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.84 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  31.41 
 
 		 399 aa  156  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.98 
 
 		 383 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31.01 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.58 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.48 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.48 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  31.42 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.45 
 
 		 321 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.89 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.01 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  31.34 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.28 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.71 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  27.81 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.82 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.32 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  26.63 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  28.57 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.82 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  28.27 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  28.27 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  28.27 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  28.27 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  28.27 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.83 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.51 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  28.27 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  28.27 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  28.27 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  28.27 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  29.41 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  29.84 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  25.54 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  29.06 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.17 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1908  ROK family protein  29.13 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.477922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>