More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0665 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  100 
 
 		 392 aa  751    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  51.53 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  53.49 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  51.54 
 
 		 394 aa  329  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  43.27 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  44.3 
 
 		 389 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  45.17 
 
 		 395 aa  288  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  43.16 
 
 		 503 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  41.78 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  38.26 
 
 		 410 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  42.63 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  37.6 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  37.93 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  37.34 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  36.68 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  38.54 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
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NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  37.24 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  37.89 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  39.63 
 
 		 403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  38.34 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  41.73 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  36.73 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
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NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  36.42 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  32.96 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  32.96 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.5 
 
 		 401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  32.64 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  32.11 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
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NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  32.69 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  37.5 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  28.95 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  36.44 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  34.42 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  36.92 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  34.4 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  34.97 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  31.96 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  30.13 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  27.2 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1908  ROK family protein  30.81 
 
 		 391 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.477922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.64 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  33.9 
 
 		 397 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.83 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  31.72 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  32.89 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.8 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32.11 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  31.91 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  32.79 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.54 
 
 		 383 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.08 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  28.73 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  28.12 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.9 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.23 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.7 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  33.24 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.61 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  32.02 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.02 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.06 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.76 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.78 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  29.34 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.31 
 
 		 396 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 405 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  30.18 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.79 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.78 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.17 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  29.17 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  27.51 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  27.51 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  27.51 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  28.21 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  24.73 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.57 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.91 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.34 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
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NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  23.01 
 
 		 388 aa  122  9e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  28.1 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.05 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.7 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  31.49 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  28.05 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  27.82 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27.82 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  27.82 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  27.82 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  34.06 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  27.82 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.75 
 
 		 406 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
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NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.43 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  31.91 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  28.12 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.33 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
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NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.33 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.21 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.35 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
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