More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0581 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  100 
 
 
416 aa  847    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  68.64 
 
 
405 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  66.91 
 
 
405 aa  569  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  66.67 
 
 
434 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  48.76 
 
 
405 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  47.25 
 
 
405 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  48 
 
 
405 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  47.5 
 
 
405 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  48 
 
 
405 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  47.75 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  47.75 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  46.52 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  46.52 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  46.52 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  46.52 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  46.52 
 
 
407 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  46.52 
 
 
406 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  46.63 
 
 
406 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  46.63 
 
 
406 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  46.63 
 
 
406 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  46.63 
 
 
406 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  46.63 
 
 
406 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  46.63 
 
 
406 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  46.63 
 
 
406 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  46.63 
 
 
406 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  46.63 
 
 
406 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  44.75 
 
 
404 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  43.81 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  44.25 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  44.75 
 
 
408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  44.36 
 
 
407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  44.75 
 
 
408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  44.75 
 
 
408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  44.25 
 
 
407 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  44.25 
 
 
407 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  43.46 
 
 
406 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  43.46 
 
 
406 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  43.46 
 
 
406 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  43.46 
 
 
406 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  43.46 
 
 
406 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  43.75 
 
 
407 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  42.82 
 
 
404 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  43.7 
 
 
406 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  43.7 
 
 
406 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  43.7 
 
 
406 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  43.7 
 
 
406 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  43.7 
 
 
406 aa  331  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  43.7 
 
 
406 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  43.7 
 
 
406 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  43.7 
 
 
406 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  43.7 
 
 
406 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  41.83 
 
 
404 aa  328  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  41.52 
 
 
408 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  42.67 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.64 
 
 
396 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.75 
 
 
410 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.74 
 
 
383 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.15 
 
 
389 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  30.32 
 
 
407 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.87 
 
 
391 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  28.8 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.35 
 
 
408 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  30.32 
 
 
402 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.76 
 
 
396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  28 
 
 
425 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.27 
 
 
395 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  33.59 
 
 
399 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  27.38 
 
 
425 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.28 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.08 
 
 
410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.45 
 
 
418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.81 
 
 
401 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.65 
 
 
409 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.43 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  27.25 
 
 
403 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.64 
 
 
408 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  27.59 
 
 
417 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.58 
 
 
406 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  29.09 
 
 
408 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  27.03 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  25.72 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  27.82 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.2 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  27.23 
 
 
395 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.18 
 
 
397 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  28.62 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.1 
 
 
398 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  28.25 
 
 
401 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  27.88 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  27.93 
 
 
405 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  26.26 
 
 
395 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  26.79 
 
 
402 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  27.11 
 
 
427 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  24.73 
 
 
386 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  26.18 
 
 
410 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.47 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  26.67 
 
 
401 aa  136  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  26.49 
 
 
378 aa  135  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  28.33 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.53 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>