More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1491 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  100 
 
 
410 aa  796    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  30.73 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.87 
 
 
396 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  33.62 
 
 
409 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.17 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.25 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  36.16 
 
 
390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.16 
 
 
418 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  33.59 
 
 
503 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  35.04 
 
 
392 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.83 
 
 
396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  32.19 
 
 
402 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.88 
 
 
410 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.71 
 
 
389 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  29.06 
 
 
399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.32 
 
 
400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  31.25 
 
 
404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  34.63 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  32.28 
 
 
427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  33.42 
 
 
392 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  25 
 
 
408 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.62 
 
 
408 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  33.33 
 
 
395 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.07 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.18 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.91 
 
 
352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.82 
 
 
391 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.89 
 
 
405 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  31.38 
 
 
402 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.41 
 
 
434 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  31.3 
 
 
395 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.61 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.84 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  32.86 
 
 
390 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.2 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.34 
 
 
386 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  32.19 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  34.83 
 
 
417 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.41 
 
 
401 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30.03 
 
 
399 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.41 
 
 
405 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  34.31 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.66 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  26.18 
 
 
416 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.39 
 
 
312 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  34.07 
 
 
321 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  30.91 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  35.59 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 
413 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  31.71 
 
 
409 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.62 
 
 
312 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  35.29 
 
 
302 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.73 
 
 
429 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.96 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.63 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  35.4 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  33.69 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  33.23 
 
 
315 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  33.65 
 
 
314 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  34.3 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  33.42 
 
 
393 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  32.94 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.1 
 
 
347 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  30.26 
 
 
420 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  25.99 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.66 
 
 
406 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  32.53 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  34.5 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  26.82 
 
 
406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.2 
 
 
401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  26.96 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  32.87 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  31.13 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  31.69 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.34 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  31.9 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.49 
 
 
315 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  32.24 
 
 
405 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  31.14 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  29.9 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  25.27 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  25.9 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  33.72 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.12 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  28.53 
 
 
378 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  32.28 
 
 
315 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.95 
 
 
422 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  30.99 
 
 
443 aa  126  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  27.1 
 
 
396 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  32.63 
 
 
383 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  23.93 
 
 
402 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.86 
 
 
405 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
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NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.35 
 
 
342 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.09 
 
 
406 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.09 
 
 
406 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  29.87 
 
 
390 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  26.09 
 
 
406 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  26.88 
 
 
316 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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