More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 420 aa  820    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  68.77 
 
 		 393 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  65.08 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  64.66 
 
 		 401 aa  478  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  48.5 
 
 		 402 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  49.01 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  49.6 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  44.21 
 
 		 389 aa  292  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  42.86 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  44.79 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  41.03 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  41.93 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  38.13 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  39.73 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  38.13 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  39.24 
 
 		 429 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  36.06 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  34.54 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  35.28 
 
 		 395 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  37.56 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  34.1 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  34.73 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  35.41 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  35.88 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  29.92 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  29.92 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  29.92 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  29.92 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  36.16 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  35.15 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  28.72 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  30.95 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  32.68 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  33.71 
 
 		 406 aa  167  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  35.54 
 
 		 403 aa  166  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  29.09 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.57 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  31.38 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.88 
 
 		 409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  29.43 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  29.92 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  29.31 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.91 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  29.53 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  32.24 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.71 
 
 		 410 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  28.5 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.09 
 
 		 410 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.22 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  29.67 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  28.5 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  28.5 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  28.5 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  32.87 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  27.51 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  27.51 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  27.51 
 
 		 406 aa  156  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  27.44 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  27.44 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  27.44 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.96 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  35.28 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  27.44 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  27.44 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  33.8 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  27.44 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  29.67 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  30.95 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.07 
 
 		 395 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  28.24 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.55 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  28.24 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  35.21 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.12 
 
 		 401 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  31.58 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  27.25 
 
 		 407 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  29.07 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  27.85 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  29.69 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  31.47 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.32 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.27 
 
 		 408 aa  149  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  35.69 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  29.53 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  33.42 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.06 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  32.96 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  29.7 
 
 		 407 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>