More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0580 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  100 
 
 
410 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  84.48 
 
 
406 aa  673    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  63.06 
 
 
395 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  64.04 
 
 
392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  61.21 
 
 
503 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  60.53 
 
 
405 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  54.59 
 
 
395 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  57.59 
 
 
403 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  51.68 
 
 
402 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  47.62 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  43.49 
 
 
389 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  43.65 
 
 
420 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  47.97 
 
 
392 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  45.88 
 
 
443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  41.93 
 
 
395 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  41.93 
 
 
427 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  42.24 
 
 
405 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  39.74 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  44.01 
 
 
409 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  43.55 
 
 
393 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  43.47 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  39.08 
 
 
389 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  43.26 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  38.6 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  38.26 
 
 
392 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  38.69 
 
 
372 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  44.01 
 
 
389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  37.23 
 
 
384 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  38.34 
 
 
394 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  36.96 
 
 
381 aa  209  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  37.24 
 
 
408 aa  206  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  36.89 
 
 
381 aa  206  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  36.81 
 
 
397 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  36.58 
 
 
406 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  33.33 
 
 
395 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  36.76 
 
 
429 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.75 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.89 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  36.94 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  35.47 
 
 
422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  35.26 
 
 
389 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  34.4 
 
 
391 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.82 
 
 
401 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  35.85 
 
 
400 aa  176  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  37.91 
 
 
404 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  32.61 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  35.85 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  32.96 
 
 
396 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  34.67 
 
 
402 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  34.99 
 
 
429 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  30.66 
 
 
455 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  30.1 
 
 
397 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.98 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  34.59 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.82 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  29.6 
 
 
399 aa  163  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.65 
 
 
408 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.65 
 
 
410 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  33.5 
 
 
396 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.91 
 
 
396 aa  160  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  31.33 
 
 
428 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  33.99 
 
 
393 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  30.18 
 
 
396 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.84 
 
 
405 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.13 
 
 
418 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.87 
 
 
399 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  27.39 
 
 
408 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.91 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.91 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  28.88 
 
 
400 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  30.05 
 
 
396 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.99 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.53 
 
 
404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.95 
 
 
398 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  32.88 
 
 
410 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1908  ROK family protein  31.18 
 
 
391 aa  149  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.477922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.25 
 
 
315 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  31.28 
 
 
414 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  29.13 
 
 
405 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  33.42 
 
 
402 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.74 
 
 
407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  29.79 
 
 
399 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.31 
 
 
385 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  33.71 
 
 
420 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  31.73 
 
 
393 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.04 
 
 
389 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.65 
 
 
405 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.37 
 
 
425 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  33.99 
 
 
418 aa  143  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25 
 
 
388 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  29.29 
 
 
401 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.18 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  32.69 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.37 
 
 
364 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.61 
 
 
434 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.07 
 
 
420 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.65 
 
 
393 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.98 
 
 
417 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.4 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  33.33 
 
 
347 aa  136  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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