More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1684 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  100 
 
 
400 aa  794    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  34.01 
 
 
396 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  34.26 
 
 
396 aa  213  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  31.99 
 
 
399 aa  209  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.03 
 
 
395 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  35.22 
 
 
408 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  32.42 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  31.38 
 
 
383 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  33.25 
 
 
410 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  29.23 
 
 
405 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.5 
 
 
399 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  29.17 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.95 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  29.68 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  35 
 
 
322 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.63 
 
 
386 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  29.1 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  28.69 
 
 
406 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  28.69 
 
 
406 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  28.69 
 
 
406 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  28.69 
 
 
406 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  28.69 
 
 
406 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  28.69 
 
 
406 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  31.16 
 
 
385 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  28.69 
 
 
406 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  28.69 
 
 
406 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  28.69 
 
 
406 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.95 
 
 
405 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  27 
 
 
406 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27 
 
 
406 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  27 
 
 
406 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  27 
 
 
406 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  28.81 
 
 
408 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  27 
 
 
406 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.39 
 
 
404 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  28.33 
 
 
404 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  26.37 
 
 
407 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.58 
 
 
406 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.95 
 
 
391 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.29 
 
 
418 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.5 
 
 
397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.11 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.99 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.62 
 
 
402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  25.44 
 
 
404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.29 
 
 
409 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  32.58 
 
 
400 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  31.5 
 
 
364 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  25.69 
 
 
404 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  26 
 
 
408 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  26 
 
 
408 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  26 
 
 
408 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  26.25 
 
 
407 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  27.32 
 
 
406 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.14 
 
 
414 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  28.04 
 
 
407 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.03 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  30.09 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.17 
 
 
398 aa  166  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.84 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.78 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  27.32 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  31.4 
 
 
401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  28.14 
 
 
408 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  28.26 
 
 
406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  29.24 
 
 
435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  29.27 
 
 
404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.49 
 
 
410 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  27.99 
 
 
406 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.32 
 
 
428 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  27.99 
 
 
406 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  30.74 
 
 
342 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  36.1 
 
 
313 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  27.99 
 
 
406 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  28.57 
 
 
388 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.38 
 
 
315 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.38 
 
 
315 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  27.72 
 
 
406 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  28.28 
 
 
390 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  28.39 
 
 
396 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  33.93 
 
 
399 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.32 
 
 
315 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  30.18 
 
 
400 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  27.17 
 
 
406 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  29.27 
 
 
398 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  27.17 
 
 
406 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  27.17 
 
 
406 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  26.9 
 
 
407 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.07 
 
 
396 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.13 
 
 
404 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  27.17 
 
 
406 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  30.75 
 
 
402 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  27.17 
 
 
406 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  27.17 
 
 
406 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.85 
 
 
404 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  29.92 
 
 
381 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  27.17 
 
 
406 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  27.17 
 
 
406 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  25.71 
 
 
414 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>