More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2553 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  100 
 
 
390 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  38.12 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  43.51 
 
 
401 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  37.83 
 
 
400 aa  201  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  33.16 
 
 
428 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  33.68 
 
 
393 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.64 
 
 
408 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31570  transcriptional regulator/sugar kinase  36.36 
 
 
380 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.556832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  36.34 
 
 
390 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  33.51 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2815  ROK family protein  36.68 
 
 
389 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231049  normal  0.37172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.35 
 
 
391 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  33.43 
 
 
404 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  35.54 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  32.69 
 
 
405 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2213  ROK family protein  30.95 
 
 
423 aa  162  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.915289  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  33.96 
 
 
417 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.97 
 
 
400 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.35 
 
 
410 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  34.59 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  29.38 
 
 
406 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  32.98 
 
 
401 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.35 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  27.97 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27.97 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  27.97 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.33 
 
 
434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  27.97 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  27.97 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.44 
 
 
386 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  27.81 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  27.81 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  27.81 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  27.81 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  27.81 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.81 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.81 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  27.81 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  27.81 
 
 
406 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.55 
 
 
396 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.6 
 
 
399 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.04 
 
 
405 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  30.48 
 
 
425 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07440  transcriptional regulator/sugar kinase  36.48 
 
 
387 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  28.4 
 
 
407 aa  143  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30.48 
 
 
425 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.51 
 
 
405 aa  143  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  26.2 
 
 
408 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  26.2 
 
 
408 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  25.9 
 
 
408 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  34.14 
 
 
417 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  31.05 
 
 
425 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  26.84 
 
 
407 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.72 
 
 
396 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.79 
 
 
352 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  27.12 
 
 
407 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  28.53 
 
 
407 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  27.05 
 
 
406 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  27.54 
 
 
404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.92 
 
 
429 aa  136  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.21 
 
 
417 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  25.59 
 
 
408 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  33.12 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  29.86 
 
 
442 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  29.95 
 
 
401 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.39 
 
 
409 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  28.15 
 
 
404 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  26.81 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.28 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.39 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  26.69 
 
 
406 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  33.97 
 
 
387 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.3 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  33.24 
 
 
382 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  26.49 
 
 
407 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  31.74 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.55 
 
 
422 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.62 
 
 
418 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  26.4 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.57 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  26.4 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  26.4 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1484  NagC family Transcriptional regulator  27.34 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.511985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  26.4 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.45 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27.25 
 
 
404 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  30.46 
 
 
417 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  26.06 
 
 
435 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  29.61 
 
 
410 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  25.77 
 
 
406 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  25.77 
 
 
406 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  25.77 
 
 
406 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.17 
 
 
398 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.26 
 
 
395 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.2 
 
 
400 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  25.77 
 
 
406 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  29.25 
 
 
372 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  31.07 
 
 
402 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  25.77 
 
 
406 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  25.77 
 
 
406 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>