More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1182 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  89.87 
 
 		 396 aa  685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  100 
 
 		 396 aa  787    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  46.92 
 
 		 401 aa  328  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  43.3 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  39.04 
 
 		 402 aa  265  8e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  40.37 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  39.58 
 
 		 393 aa  255  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  40.05 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  38.38 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  38.92 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  36.49 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  38.13 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  38.79 
 
 		 418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  37.18 
 
 		 393 aa  233  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  38.16 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  38.32 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  35.46 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  35.13 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  33.33 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  36.95 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  36.41 
 
 		 410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  36.46 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.96 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  34.44 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.88 
 
 		 503 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  30.45 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.07 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  33.33 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.65 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  30.89 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.5 
 
 		 410 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.63 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.52 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.52 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  29 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.08 
 
 		 386 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.63 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  31.58 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.96 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  34.29 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  26.85 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  31.68 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  33.06 
 
 		 392 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.59 
 
 		 395 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  33.61 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  31.09 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.76 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.61 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  31.48 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.28 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  30.5 
 
 		 443 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.71 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.61 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.79 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  29.12 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.92 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  31.08 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  29.32 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.56 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  28.14 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.32 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  30.2 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.65 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.41 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.97 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.43 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  28.08 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.87 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  31.41 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  29.01 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  29.59 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  30.69 
 
 		 392 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  26.54 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  30.87 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  29.57 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  28.68 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.83 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.83 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.79 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  31.12 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.07 
 
 		 316 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  27.49 
 
 		 427 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  26.42 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.56 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  34.81 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1271  ROK family protein  30.75 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0499308  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  26.42 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.91 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  28.97 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  26.42 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  26.42 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  26.42 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  30.84 
 
 		 327 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.82 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  30.84 
 
 		 327 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  28.03 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  28.02 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.23 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>