More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3727 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  100 
 
 		 397 aa  778    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  70.03 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  52.96 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  47.84 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  51.42 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  46.73 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  45.09 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  37.47 
 
 		 410 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  35.01 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31.3 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30.26 
 
 		 399 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.77 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.06 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  30.41 
 
 		 383 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.15 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.5 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  33.42 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.5 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  32.52 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  32.56 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.24 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.23 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.98 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  33.13 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.03 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.53 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.75 
 
 		 397 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  32.61 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  31.35 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  28.27 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.27 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.03 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.25 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  33.85 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  29.27 
 
 		 435 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  26.26 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.73 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.64 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.53 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  34.01 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.43 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  31.02 
 
 		 417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  28.07 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  32.2 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.5 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.16 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  32.22 
 
 		 429 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  32.53 
 
 		 503 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.94 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.3 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.28 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.57 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.46 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  31.08 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  30.43 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  31.1 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.98 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.64 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  29.2 
 
 		 414 aa  136  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.19 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  30.21 
 
 		 396 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  25.54 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  31.13 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  32.32 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  23.05 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.59 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.24 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.85 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25.71 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30.49 
 
 		 425 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.2 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  27.11 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.23 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  32.38 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.13 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  28.7 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  31.25 
 
 		 395 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.41 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  32.29 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  28.32 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  27.07 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  28.57 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  28.57 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  30.42 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  28.57 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  28.57 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  28.57 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  28.57 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.53 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  28.57 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.69 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  28.57 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  27.67 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.77 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  31.43 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  24.74 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  28.49 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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