More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1189 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  100 
 
 		 374 aa  749    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  96.22 
 
 		 402 aa  704    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  54.13 
 
 		 371 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  34.74 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.43 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  32.64 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.42 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.81 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.46 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.11 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.61 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.85 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.79 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.2 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.66 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.69 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.7 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.62 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30.55 
 
 		 435 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.17 
 
 		 404 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.29 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.77 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.48 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  27.18 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  32.8 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30.11 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.92 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.58 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.48 
 
 		 503 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.37 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.3 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.13 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.05 
 
 		 417 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  31.83 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  33.22 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  29.27 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  30.48 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.31 
 
 		 417 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.47 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  29.7 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.23 
 
 		 399 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.08 
 
 		 410 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  32 
 
 		 410 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  30.75 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  28.34 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  26.1 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  31.12 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.2 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  28.46 
 
 		 408 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.57 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  28.79 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.48 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.92 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  28.82 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  31.4 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.57 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  31.71 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  28.46 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.27 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  26.79 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  28.46 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  33.91 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  26.05 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  28.28 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.54 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  34.41 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  31.99 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  29.97 
 
 		 302 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.84 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  25.79 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  25.79 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  26.68 
 
 		 405 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  25.79 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  27.32 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  24.92 
 
 		 317 aa  126  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  25.79 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  25.79 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  25.79 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  25.79 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  25.79 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28 
 
 		 400 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.82 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  27.68 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  24.58 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
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NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  29.23 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
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NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  32.02 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.79 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.91 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  26.42 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  31.41 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  29.19 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.25 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  26.42 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  26.42 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  26.32 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.74 
 
 		 407 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.36 
 
 		 398 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  26.13 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  26.13 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  26.13 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
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