More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2379 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  100 
 
 
417 aa  823    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  81.49 
 
 
417 aa  679    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  38.52 
 
 
425 aa  260  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  39.59 
 
 
429 aa  242  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  35.4 
 
 
414 aa  216  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  35.85 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  41.33 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  40.21 
 
 
421 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  36.59 
 
 
417 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  33.41 
 
 
424 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  33.75 
 
 
754 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  30.81 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  38.65 
 
 
382 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  29.38 
 
 
399 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  36.06 
 
 
402 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  32.32 
 
 
389 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.73 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  36.64 
 
 
379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  31.58 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  30.52 
 
 
410 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  37.6 
 
 
409 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  31.88 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  31.23 
 
 
400 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  31.35 
 
 
397 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  39.23 
 
 
350 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.99 
 
 
391 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.9 
 
 
417 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  28.57 
 
 
372 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  31.79 
 
 
390 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  31.27 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.82 
 
 
400 aa  141  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.26 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  31.03 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  26.72 
 
 
406 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  30.11 
 
 
401 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.63 
 
 
408 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.7 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.9 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.65 
 
 
428 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.28 
 
 
414 aa  136  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.54 
 
 
503 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.7 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  34.02 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.38 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.79 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.68 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.48 
 
 
402 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  30.09 
 
 
389 aa  133  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  35.14 
 
 
401 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  28.44 
 
 
414 aa  133  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  31.23 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.32 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.44 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  28.44 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.61 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  33.62 
 
 
382 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  29.94 
 
 
417 aa  130  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  30.11 
 
 
448 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  27.07 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08010  transcriptional regulator/sugar kinase  34.92 
 
 
368 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  32.44 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.89 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.57 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.71 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  28.57 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  30.64 
 
 
389 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  34.66 
 
 
389 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  32.05 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  35.71 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  36.04 
 
 
390 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.2 
 
 
403 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  28.96 
 
 
425 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  28.83 
 
 
395 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  29.85 
 
 
418 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.05 
 
 
402 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  23.14 
 
 
388 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  28.72 
 
 
408 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.81 
 
 
395 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.88 
 
 
404 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.14 
 
 
409 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.71 
 
 
406 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  30.38 
 
 
317 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.06 
 
 
395 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  28.57 
 
 
435 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.28 
 
 
395 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.74 
 
 
400 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  29.78 
 
 
327 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.39 
 
 
397 aa  123  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.36 
 
 
425 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.81 
 
 
404 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  27.96 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  29.26 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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