More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3173 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  100 
 
 
435 aa  888    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  46.42 
 
 
425 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  45.89 
 
 
425 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  46.42 
 
 
425 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  41.88 
 
 
414 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  33.42 
 
 
428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.53 
 
 
408 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  31.59 
 
 
442 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  30.66 
 
 
404 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.66 
 
 
405 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.28 
 
 
401 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1684  ROK family protein  28.68 
 
 
391 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805279  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.53 
 
 
393 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1865  ROK family protein  28.12 
 
 
399 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.57 
 
 
400 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.45 
 
 
418 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  26.05 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  30.4 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.9 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.9 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  27.56 
 
 
398 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.65 
 
 
315 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.49 
 
 
396 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.27 
 
 
397 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30 
 
 
429 aa  146  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.5 
 
 
399 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.27 
 
 
425 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  31.52 
 
 
401 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  31.87 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.11 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.91 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  27.03 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.25 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  28.7 
 
 
410 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  29.75 
 
 
378 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.29 
 
 
386 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.27 
 
 
405 aa  140  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  31.83 
 
 
390 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.1 
 
 
396 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  28 
 
 
404 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  28.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  28.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  28.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.46 
 
 
383 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  27.38 
 
 
408 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  28.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27.86 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  27.16 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  27.86 
 
 
406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  27.86 
 
 
406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  27.86 
 
 
406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  28 
 
 
404 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  27.86 
 
 
406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27.86 
 
 
406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  30.03 
 
 
405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  31.56 
 
 
448 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.3 
 
 
315 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.3 
 
 
315 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  31.56 
 
 
402 aa  136  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  29.72 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.56 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  28.96 
 
 
395 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.78 
 
 
404 aa  133  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  26.45 
 
 
385 aa  133  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  29.52 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  30.36 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  27.95 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  27.96 
 
 
401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.82 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.71 
 
 
406 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.5 
 
 
408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  26.23 
 
 
408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  26.89 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  26.23 
 
 
408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.9 
 
 
322 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.35 
 
 
397 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.31 
 
 
390 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  27.79 
 
 
407 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  27.6 
 
 
390 aa  130  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  31.47 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  27.95 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  27.95 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  25.84 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  27.95 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  30.77 
 
 
436 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0571556 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  27.95 
 
 
406 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.77 
 
 
414 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  25.93 
 
 
408 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.14 
 
 
320 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  28.66 
 
 
406 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.27 
 
 
312 aa  127  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  28.66 
 
 
406 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  28.66 
 
 
406 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  26.83 
 
 
407 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  28.66 
 
 
406 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
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