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for query gene Rxyl_0399 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  100 
 
 
402 aa  788    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  54.76 
 
 
395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  54.76 
 
 
395 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  56.08 
 
 
503 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  53.77 
 
 
392 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  57.41 
 
 
405 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  51.68 
 
 
410 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  50.13 
 
 
406 aa  348  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  53.33 
 
 
392 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  50.53 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  47.91 
 
 
389 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  46.51 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  46.02 
 
 
443 aa  318  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  49.33 
 
 
390 aa  315  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  45.23 
 
 
420 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  43.81 
 
 
427 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  48 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  41.54 
 
 
395 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  43.27 
 
 
392 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  42.27 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  42.01 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  46.94 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  40.57 
 
 
394 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  44.04 
 
 
409 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  39.52 
 
 
389 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  43.82 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  38.57 
 
 
372 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  42.01 
 
 
389 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  37.3 
 
 
381 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  37.3 
 
 
381 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  37.53 
 
 
408 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  37.77 
 
 
401 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  36.03 
 
 
429 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  37.63 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  35.64 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.11 
 
 
414 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  30.21 
 
 
391 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  38.08 
 
 
404 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  36.04 
 
 
409 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  36.46 
 
 
387 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  35.88 
 
 
397 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  35.77 
 
 
401 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  34.49 
 
 
422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  35.29 
 
 
389 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  35.49 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  36.14 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.58 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  30.64 
 
 
455 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  34.97 
 
 
393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.82 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  33.24 
 
 
396 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  34.44 
 
 
396 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  34.09 
 
 
402 aa  169  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.53 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32.99 
 
 
396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  32 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  34.73 
 
 
420 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  32.38 
 
 
399 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.3 
 
 
400 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.15 
 
 
397 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.81 
 
 
396 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  33.33 
 
 
321 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.22 
 
 
321 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  31.44 
 
 
393 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.51 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.4 
 
 
428 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.37 
 
 
402 aa  153  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.31 
 
 
396 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  32.19 
 
 
410 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.11 
 
 
399 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.75 
 
 
399 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  27.66 
 
 
408 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  29.1 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  29.23 
 
 
404 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.87 
 
 
315 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.87 
 
 
315 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  28.57 
 
 
400 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.18 
 
 
404 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  31.13 
 
 
389 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.74 
 
 
388 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  28.72 
 
 
404 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.01 
 
 
417 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  29.23 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.18 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  31.83 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  31.56 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.68 
 
 
401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
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NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.35 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
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NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.25 
 
 
315 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.76 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.13 
 
 
434 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.75 
 
 
425 aa  139  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
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NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  27.01 
 
 
378 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.86 
 
 
405 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  26.79 
 
 
416 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_1271  ROK family protein  29.81 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0499308  normal  0.418273 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  28.84 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
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NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  29.72 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.48 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
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