More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6619 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  93 
 
 		 400 aa  742    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  100 
 
 		 400 aa  812    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  45.73 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  38.82 
 
 		 417 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  38.65 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  36.67 
 
 		 379 aa  242  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  37.41 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  36.91 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  35.25 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  33 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  32.56 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  31.76 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  31.91 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  37.84 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  31.85 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  31.85 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  30.18 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  31.39 
 
 		 417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  35.47 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.23 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  29.02 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  30.85 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  29.15 
 
 		 410 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  30.15 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.61 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  29.9 
 
 		 415 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.36 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  29.6 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  29.15 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  29.65 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  29.65 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  29.65 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  29.1 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  29.35 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  29.28 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  29.97 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  29.4 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.54 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.85 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  31.66 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  28.72 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  29.82 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  29.38 
 
 		 416 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  30.11 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  28.88 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  34.55 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  27.38 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  30.35 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  29.24 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.35 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  28.43 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.59 
 
 		 398 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.43 
 
 		 410 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.03 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  30.15 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  30.08 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.43 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  34.82 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.89 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  29.56 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  28.75 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  29.08 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.5 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.64 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  35 
 
 		 414 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  28.68 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  28.68 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  28.47 
 
 		 415 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  32.62 
 
 		 396 aa  136  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  28.07 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.21 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.41 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  35.34 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  28.7 
 
 		 374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  29.06 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  29.97 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  28.31 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  28.57 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  30.18 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.25 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.84 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  35.86 
 
 		 754 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.97 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  26.53 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  31.65 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  28.91 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  34.38 
 
 		 421 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  26.67 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  29.03 
 
 		 412 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
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NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  28.22 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.34 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  30.72 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.99 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  28.31 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.32 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  26.55 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  35 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
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