More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0536 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  100 
 
 		 410 aa  806    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  69.02 
 
 		 404 aa  541  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  68.16 
 
 		 414 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_1899  ROK  64.88 
 
 		 409 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  61.67 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  54.59 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  48.35 
 
 		 416 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  49.01 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0891  ROK  48.88 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  41.38 
 
 		 411 aa  282  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  39.64 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  39.54 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  39.27 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  37.06 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  39.39 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  37.38 
 
 		 439 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  37.06 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  39.02 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
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NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  38 
 
 		 410 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  40.25 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  35.45 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  39.62 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  35.75 
 
 		 413 aa  225  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  36.04 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  36.04 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  36.2 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
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NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  35.95 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  35.95 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  36.57 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  35.7 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  35.09 
 
 		 416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  35.09 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  35.34 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  36.98 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A1654  ROK  35.71 
 
 		 420 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  28.22 
 
 		 404 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.15 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  31.17 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  28.68 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  29.53 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  32.08 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
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NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  28.97 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  31.59 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  31.2 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  31.81 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
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NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  29.63 
 
 		 412 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  30.56 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.98 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  28.46 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  29.58 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  33.33 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  25.98 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  26.6 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  25.32 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  28.86 
 
 		 429 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  25.27 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  27.79 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  25.53 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  26.45 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  29.31 
 
 		 399 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  28.02 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  26.2 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.14 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  27.09 
 
 		 754 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  21.46 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  29.96 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.27 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.97 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  24.42 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  24.42 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  21.9 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  31.82 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
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NC_012848  Rleg_4714  putative transcriptional regulator protein, ROK family  26.72 
 
 		 379 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  24.74 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  26.25 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  26.89 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
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NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  21.68 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.24 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  23.88 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  31.91 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  26.53 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.32 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  21.86 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  26.85 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0718  ROK family protein  33.47 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  22.02 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  25.25 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  28.86 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  27.66 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  25.44 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_1583  ROK protein  29.58 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  26.32 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  25.43 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  25.32 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  27.49 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  24.63 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  28.8 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
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NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  23.29 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
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