More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1108 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  100 
 
 		 382 aa  746    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  40.5 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  34.68 
 
 		 417 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  35.05 
 
 		 429 aa  179  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  33.25 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  33.83 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08010  transcriptional regulator/sugar kinase  38.81 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  32.61 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  33.74 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  33.5 
 
 		 421 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.02 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.98 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  30.9 
 
 		 397 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.27 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.49 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  30.33 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  33.68 
 
 		 403 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  31.03 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  33.59 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  40.14 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.87 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.68 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  32.88 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  32.12 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  34.3 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.98 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  32.03 
 
 		 443 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  31.45 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  31.33 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  28.65 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.05 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  33.58 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  35.55 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  27.64 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.11 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.53 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  31.3 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.73 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.61 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  30.05 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.55 
 
 		 406 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.92 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.6 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  31.27 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  28.49 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  34.48 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.46 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.94 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  33.2 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  31.23 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  30.87 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  34.23 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  30.38 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  28.02 
 
 		 754 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  31.73 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.31 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  30.52 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  28.72 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  27.32 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  28.22 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.77 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  31.61 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  29.65 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  33.07 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  31.94 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  27.75 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  29.52 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  36.11 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  33.6 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  31.62 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  30.51 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.49 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  33.83 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  25.96 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  25.5 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  29.71 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  28.25 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  27.57 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0407  ROK family protein  20.33 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  29.43 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  30.43 
 
 		 372 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  33.98 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  34.63 
 
 		 434 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  22.25 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  23.34 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.77 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  30.75 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.64 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  33.96 
 
 		 473 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  24.75 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  34.55 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  21.81 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.01 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  27.49 
 
 		 435 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.37 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  31.93 
 
 		 442 aa  96.3  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  32.81 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  23.22 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>