More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3392 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  100 
 
 		 401 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  90.77 
 
 		 401 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  67.41 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  38.89 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  38.65 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  39.26 
 
 		 400 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  35.49 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  33.33 
 
 		 379 aa  193  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  33.42 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.88 
 
 		 417 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  33.5 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  32.74 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  33.42 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  30.42 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  32.84 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.95 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  30.3 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  34.33 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  30.92 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  32.61 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  34.04 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  30.67 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  33.04 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
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NC_007802  Jann_1372  ROK  29.43 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
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NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  35.14 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  30.12 
 
 		 439 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  30.07 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  28.93 
 
 		 415 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  32.37 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  31.77 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  29.83 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  28.46 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  30.33 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  30.41 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  31.5 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  29.97 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  29.64 
 
 		 410 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  28.43 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
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NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  29.35 
 
 		 421 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  29.58 
 
 		 410 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  34.54 
 
 		 754 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  32.59 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  30.51 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  27.05 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  30.51 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  30.08 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1654  ROK  31.18 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  30.37 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  30.12 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  30.12 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  29.88 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  29.88 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  30.54 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  30.54 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  30.34 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  33.2 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  34.02 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  34.56 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  27.13 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.61 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  27.13 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  25.68 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.34 
 
 		 386 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.99 
 
 		 398 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.43 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  34.57 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  29.79 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  28.95 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  35.82 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  29.66 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  30.72 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.86 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  31.71 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  33.45 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  28.96 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  27.08 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  26.45 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  29.97 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.1 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  31.91 
 
 		 402 aa  98.2  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.97 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  28.15 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  26.23 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  29.75 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  26.6 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  26.27 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.61 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.12 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  28.78 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.97 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  25.2 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  27.64 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  32.11 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.35 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.01 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
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NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  31.95 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
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NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  30.41 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
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