More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0212 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  95.67 
 
 		 416 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  80.29 
 
 		 415 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  100 
 
 		 416 aa  826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  81.73 
 
 		 415 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  81.25 
 
 		 415 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  81.73 
 
 		 415 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  81.25 
 
 		 415 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  81.01 
 
 		 415 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  95.91 
 
 		 416 aa  795    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  95.67 
 
 		 416 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  80.05 
 
 		 416 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  60.38 
 
 		 420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  36.23 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  34.45 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  34.51 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  33.93 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  34.45 
 
 		 414 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  35.34 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  33.68 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  35.66 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  34.02 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  31.36 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  32.47 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  31.87 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  31.78 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  32.06 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  32.69 
 
 		 407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  32.05 
 
 		 416 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  32.26 
 
 		 418 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  32.99 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  32.73 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  31.5 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  32.15 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  31.44 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  32.41 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  29.85 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  30.56 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  26.42 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  30.85 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  31.33 
 
 		 412 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  30.64 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  30.52 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  26.58 
 
 		 390 aa  140  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  30.5 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  28.68 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.93 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  30.29 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  29.84 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  31.33 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.12 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  30.73 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  31.89 
 
 		 402 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  28.04 
 
 		 421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.7 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  29.75 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  26.13 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  28.08 
 
 		 370 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  28.08 
 
 		 370 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  29.8 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  27.12 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  29.66 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.9 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.38 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  26.17 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  31.49 
 
 		 420 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  27.3 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  29.21 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.37 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  24.47 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  26.27 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 387 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  27.51 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  29.67 
 
 		 754 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  26.51 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.94 
 
 		 397 aa  96.3  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  25.6 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  27.3 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  27.76 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.08 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.83 
 
 		 396 aa  92.8  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  26.82 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.51 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.15 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  34.21 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  27.63 
 
 		 385 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  25.1 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  27.04 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  26.76 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  28.08 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  31.02 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  29.69 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  31.98 
 
 		 421 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.77 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  28.41 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.78 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  33.2 
 
 		 382 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.1 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  31.97 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  27.94 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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