More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4684 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  80.53 
 
 
416 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  100 
 
 
415 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  80.29 
 
 
416 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  98.07 
 
 
415 aa  811    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  95.9 
 
 
415 aa  775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  98.07 
 
 
415 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  80.29 
 
 
416 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  80.53 
 
 
416 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  95.9 
 
 
415 aa  774    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  97.83 
 
 
415 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  95.91 
 
 
416 aa  769    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  59.62 
 
 
420 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  37.06 
 
 
410 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  35.95 
 
 
410 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  34.02 
 
 
404 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  34.28 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  33.76 
 
 
414 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  34.28 
 
 
409 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  34.97 
 
 
406 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  32.99 
 
 
409 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  33.58 
 
 
415 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  34.34 
 
 
407 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  33.85 
 
 
416 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  33.67 
 
 
418 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  33.09 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  31.01 
 
 
398 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  32.3 
 
 
411 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  32.91 
 
 
409 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  33.59 
 
 
408 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  32.82 
 
 
413 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.89 
 
 
417 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  33.33 
 
 
410 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  30.87 
 
 
413 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  33.84 
 
 
422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  29.79 
 
 
421 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32.15 
 
 
391 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  27.11 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.65 
 
 
400 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  31.3 
 
 
396 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.67 
 
 
417 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  29.79 
 
 
407 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  29.79 
 
 
407 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.15 
 
 
400 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  32.55 
 
 
412 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  32.18 
 
 
402 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  32.27 
 
 
412 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  26.44 
 
 
390 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.99 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.68 
 
 
379 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  31.55 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  29.9 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  31.36 
 
 
401 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  33.19 
 
 
425 aa  124  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  28.8 
 
 
382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  27.34 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  29.88 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.93 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  26.65 
 
 
370 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  26.65 
 
 
370 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  30.46 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.21 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  29.06 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  27.03 
 
 
376 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  31.89 
 
 
420 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  24.61 
 
 
383 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  26.51 
 
 
376 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.31 
 
 
397 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  26.6 
 
 
417 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.24 
 
 
414 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  26.08 
 
 
375 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.76 
 
 
397 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.61 
 
 
399 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  29.92 
 
 
754 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  30.12 
 
 
403 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  29.91 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  26.7 
 
 
401 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.13 
 
 
386 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  25.67 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.75 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  26.48 
 
 
383 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.44 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  25.94 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  32.76 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  32.11 
 
 
421 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  25.63 
 
 
395 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  26.55 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  28.07 
 
 
417 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  29.54 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  29.59 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.4 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  28.43 
 
 
416 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.48 
 
 
400 aa  90.5  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  27.53 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
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NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  32.8 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  26.59 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
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NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  26.79 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
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NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  27 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.88 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  26.87 
 
 
389 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
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NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  29.22 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
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