More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1372 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1372  ROK  100 
 
 		 398 aa  807    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  50 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  48.68 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  47.56 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  43.67 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  40.82 
 
 		 409 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  43.12 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  43.12 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  42.48 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  37.5 
 
 		 413 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  42.49 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  40.81 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  43.24 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  37.57 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  39.79 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  40.58 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  39.47 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  40.16 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  39.02 
 
 		 410 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  39.32 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  36.94 
 
 		 416 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  35.92 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0891  ROK  37.5 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  37.08 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  31.88 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  31.88 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  31.36 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  31.01 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  31.01 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  31.01 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  30.75 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  30.41 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  30.85 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  30.15 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  31.23 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  29.85 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.87 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  30.39 
 
 		 401 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  29.43 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  29.71 
 
 		 409 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  29.67 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  28.49 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  26.4 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  27.7 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  28.57 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  28.31 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_4501  ROK  27.15 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.06 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  25.71 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  26.77 
 
 		 376 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  25.13 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.2 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  28.91 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  27.7 
 
 		 374 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  25.07 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  25.07 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  24.85 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  28.53 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  23.27 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.68 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.47 
 
 		 414 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  25.46 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  27.48 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.95 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  23.93 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  23.36 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  27.27 
 
 		 367 aa  86.7  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  27.32 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  27.23 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  27.01 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.31 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.59 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  25.32 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  27.31 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.24 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  20.6 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.24 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.56 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  28.09 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  26.12 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  25.83 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  28.17 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  24.31 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  23.31 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  24.9 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  26.88 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  26.12 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  24.62 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
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NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  29.61 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
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NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  26.37 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  25.21 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  24.55 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  27.08 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  26.04 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  23.9 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  23.91 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  25.52 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
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