More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2352 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  100 
 
 		 383 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  45.23 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  41.05 
 
 		 376 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  41.05 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  44.02 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  42.94 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  41.73 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  41.32 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  33.69 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  31.06 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  31 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  30.18 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  28.16 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  30.18 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  25.69 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  25.69 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  29.13 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.39 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28 
 
 		 417 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  25.87 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  25.87 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  24.92 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  27.94 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  26.13 
 
 		 416 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  26.36 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  25.96 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  26.56 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  24.78 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  27.93 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  28.53 
 
 		 413 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  28.95 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  26.76 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  26.45 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  26.54 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  24.36 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  24.36 
 
 		 415 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  24.56 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  24.07 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  24.07 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03250  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 233 aa  96.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  23.78 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  24.85 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  26.25 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  25.46 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.97 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  26.18 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  25.89 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  23.67 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  27.23 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  26.15 
 
 		 406 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  25.59 
 
 		 413 aa  89.7  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  26.72 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  23.91 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  23.36 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  24.35 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  25.13 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  25.61 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  26.32 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  24.93 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  25.77 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2517  xylose repressor  20.56 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  25.2 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0032  ROK family protein  20.56 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0032  ROK family protein  20.56 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  31.6 
 
 		 754 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  27.56 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  24.93 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  22.73 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  25.32 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  25.66 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  25 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  25.81 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  25.32 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.21 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  24.84 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  24.68 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  27.82 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  27.03 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.81 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  24.36 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  25.59 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  31.23 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  19.89 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  24.32 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1583  ROK protein  25.56 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  24.59 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
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NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  24.36 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  24.43 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  19.79 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  24.73 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  25.26 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  24.33 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  24.33 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  24.33 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  24.33 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  24.33 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  24.33 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  24.33 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
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