More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5083 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  90.34 
 
 		 383 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
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NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  100 
 
 		 383 aa  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  41.73 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  36.07 
 
 		 376 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  38.21 
 
 		 374 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  35.44 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  38.33 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  34.93 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  33.07 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  28.33 
 
 		 401 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 387 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  29.38 
 
 		 379 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.83 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  26.79 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  26.79 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  25.73 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.94 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  25.73 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  26.05 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.13 
 
 		 417 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  27.66 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.43 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  26.14 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  25.85 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  24.79 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  25.07 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  25.07 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  24.79 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  26.06 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  26.53 
 
 		 416 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  29.3 
 
 		 408 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  27.91 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  26.59 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  25.88 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.16 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.82 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  23.96 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  29.3 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  27.19 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  27.2 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  24.43 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  26.11 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  25.98 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  25.2 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  25.4 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  27.59 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  26.09 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  25.78 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  25.53 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  27.46 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  24.2 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  21.9 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  26.19 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  25.2 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  25.78 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.74 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  25.19 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  22.67 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  27.61 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  28.15 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  23.93 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  28.22 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  25.99 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  24.62 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1544  ROK family protein  27.75 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.693537  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  23.19 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  26.47 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  25.52 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  23.68 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  21.46 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  26.38 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  25.08 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1594  ROK family protein  27.34 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  27.76 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  25.15 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  27.27 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  24.73 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  24.52 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  24.32 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  34.39 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  24.79 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  24.45 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  23.81 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  25.94 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  25.88 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  26.71 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  25.64 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  23.1 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
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NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  21.16 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  26.36 
 
 		 754 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  24.84 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.86 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  24.05 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  25.42 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
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NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  26.86 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  24.59 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  24.61 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
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NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  26.26 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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