More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1710 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  95.19 
 
 
415 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  79.81 
 
 
416 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  95.91 
 
 
415 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  80.05 
 
 
416 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  100 
 
 
416 aa  825    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  94.95 
 
 
415 aa  763    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  95.19 
 
 
415 aa  762    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  94.95 
 
 
415 aa  763    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  79.57 
 
 
416 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  79.81 
 
 
416 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  94.71 
 
 
415 aa  762    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  60.1 
 
 
420 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  37.72 
 
 
410 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  34.7 
 
 
404 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  36.32 
 
 
410 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  34.45 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  34.27 
 
 
439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  32.9 
 
 
409 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  35.4 
 
 
406 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  34.1 
 
 
409 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  34.02 
 
 
416 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  33.25 
 
 
415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  34.75 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  32.22 
 
 
411 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  32.58 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  30.85 
 
 
398 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  34.28 
 
 
408 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  33.25 
 
 
413 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  32.77 
 
 
415 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  31.5 
 
 
417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  31.36 
 
 
409 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  32.73 
 
 
410 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  34.51 
 
 
422 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  31.28 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  29.46 
 
 
421 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  31.73 
 
 
396 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  30.71 
 
 
391 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  27.3 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  30.23 
 
 
407 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  30.23 
 
 
407 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  32.47 
 
 
412 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.34 
 
 
417 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  32.75 
 
 
412 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.07 
 
 
400 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.38 
 
 
400 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  31.47 
 
 
412 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  29.11 
 
 
379 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  31.12 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  25.85 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.91 
 
 
389 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  32.02 
 
 
401 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  29.22 
 
 
421 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.63 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  33.33 
 
 
425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  30.54 
 
 
401 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.51 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  27.27 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  27.37 
 
 
370 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  27.37 
 
 
370 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  28.46 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  29.43 
 
 
409 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  25 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  30.09 
 
 
367 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  26.78 
 
 
417 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  26.51 
 
 
376 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  26.39 
 
 
401 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  27.25 
 
 
375 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  26.23 
 
 
376 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.91 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  29.34 
 
 
754 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.13 
 
 
397 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  25.72 
 
 
374 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.05 
 
 
389 aa  99  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  32.16 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.11 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.35 
 
 
397 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  29.83 
 
 
407 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  26.98 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.45 
 
 
386 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  31.25 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.62 
 
 
398 aa  94  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  28.83 
 
 
385 aa  93.6  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  29.23 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.85 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  24.53 
 
 
387 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  26.99 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  26.6 
 
 
383 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  33.48 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.79 
 
 
400 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  25.13 
 
 
395 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.36 
 
 
408 aa  89.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  31.6 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.72 
 
 
388 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  28.82 
 
 
416 aa  87  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  32.55 
 
 
421 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  27.48 
 
 
389 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  25.95 
 
 
401 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
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NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  26.67 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  27.51 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  30.33 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0868629 
 
 
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