More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 424 aa  833    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  46.89 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  32.71 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  33.41 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.79 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.41 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  30.27 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.41 
 
 		 417 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  27.91 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  31.65 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  28.68 
 
 		 417 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  31.37 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  31.36 
 
 		 429 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.19 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  30.9 
 
 		 379 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  32.88 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  34.8 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  26.09 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.86 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.38 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.47 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.57 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  27.1 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08010  transcriptional regulator/sugar kinase  36.4 
 
 		 368 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  28.02 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  30.65 
 
 		 754 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.5 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.53 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.71 
 
 		 408 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.99 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.83 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.38 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  25.32 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  28 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.62 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  26.9 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.61 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  28.46 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.96 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  26.04 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.91 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.42 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  23.86 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.64 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  26.96 
 
 		 396 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.72 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.37 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.11 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.37 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.36 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  26.16 
 
 		 404 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  29.29 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  30.53 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  26.63 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.33 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.62 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  27.7 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  26.29 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  25.87 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  25.87 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  25.42 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.04 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.34 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.35 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  28.4 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  20.56 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.08 
 
 		 347 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.06 
 
 		 396 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.49 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.02 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  26.86 
 
 		 400 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  33.47 
 
 		 313 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  27.24 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  25.24 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  28.9 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.35 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  28.12 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 336 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  28.36 
 
 		 403 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  29.19 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.2 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  21.96 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.23 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  28.5 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.13 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.5 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  32.14 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  30.72 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  26.79 
 
 		 409 aa  94.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  25.78 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.2 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  26.39 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  27.4 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  26.27 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  27.6 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  28.3 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  23.94 
 
 		 435 aa  93.2  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  27 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  25.6 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  24.44 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>