More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2418 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  100 
 
 		 410 aa  818    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  49.1 
 
 		 409 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  48.74 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  51.28 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  49.36 
 
 		 415 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  49.1 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  48.85 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  45.66 
 
 		 413 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  50.26 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  49.61 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  49.09 
 
 		 421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  42.35 
 
 		 414 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  41.89 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  42.49 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  39.95 
 
 		 409 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  40.15 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  40.15 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  39.54 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  44.24 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  37.56 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  37.96 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  38.04 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  37.47 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  34.84 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  34.02 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  34.02 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  34.02 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  33.33 
 
 		 415 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  32.82 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  32.82 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  32.82 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  32.73 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  32.82 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  32.56 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  33.59 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  31.27 
 
 		 404 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.75 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.48 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  29.89 
 
 		 418 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.99 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  33.53 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.26 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  30.47 
 
 		 389 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  28.98 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  28.21 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  30.4 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  29.43 
 
 		 401 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  28.4 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  27.78 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.37 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  29.19 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  32.84 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.68 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  27.11 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  27.11 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  28.8 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  24.63 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  25.84 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  28.06 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  29.13 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.75 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.84 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  25.2 
 
 		 401 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.25 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  27.46 
 
 		 380 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  26.95 
 
 		 374 aa  93.2  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  27.22 
 
 		 754 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.12 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.06 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  29.5 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  28.46 
 
 		 429 aa  89.7  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  28.95 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.73 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  27.34 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.83 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  28.54 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  20.3 
 
 		 381 aa  87.8  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  26.19 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.39 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  27.5 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  28.32 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  27.56 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  26.15 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  27.81 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  25.59 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
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NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  26.92 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.36 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.26 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  32.3 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  23.53 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.37 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  26.73 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.95 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  27.02 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  25.86 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  29.55 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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