More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4127 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  100 
 
 
367 aa  734    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  80.87 
 
 
367 aa  531  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  37.99 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  33.53 
 
 
418 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.93 
 
 
417 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  28.75 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  28.75 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  32.62 
 
 
402 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  27.59 
 
 
404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  28.53 
 
 
376 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  31.13 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.76 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  30.32 
 
 
421 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  28.22 
 
 
376 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  34.48 
 
 
425 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  29.7 
 
 
421 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  31.61 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  28.83 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  29.7 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  30 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  29.7 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 
429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  31.32 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  29.07 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  31.03 
 
 
415 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  31.03 
 
 
415 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  31.03 
 
 
415 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  30.46 
 
 
415 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  29.04 
 
 
382 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  30.45 
 
 
439 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  31.75 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  30.19 
 
 
754 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  31.8 
 
 
415 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  30.71 
 
 
385 aa  116  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  30.25 
 
 
417 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  30.12 
 
 
409 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  28.06 
 
 
382 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  31.38 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.15 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.06 
 
 
417 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.76 
 
 
414 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25 
 
 
391 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  35.34 
 
 
473 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  30.48 
 
 
416 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28 
 
 
400 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  30.48 
 
 
416 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  31.76 
 
 
417 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  34.62 
 
 
416 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  30.09 
 
 
416 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  30.48 
 
 
416 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.53 
 
 
398 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  29.23 
 
 
389 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  27.62 
 
 
379 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  23.99 
 
 
391 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  26.88 
 
 
400 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.17 
 
 
393 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  27.19 
 
 
401 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  33.19 
 
 
414 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.47 
 
 
393 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  29.87 
 
 
375 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  31.82 
 
 
393 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.19 
 
 
401 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  32.89 
 
 
403 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  30.38 
 
 
406 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.34 
 
 
399 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  27.39 
 
 
401 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  26.49 
 
 
396 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  28.22 
 
 
388 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  28.06 
 
 
410 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  26.75 
 
 
414 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  25.73 
 
 
410 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.01 
 
 
389 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  28.35 
 
 
413 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.05 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  26.77 
 
 
389 aa  99.8  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  29.54 
 
 
409 aa  99.4  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  28.4 
 
 
374 aa  99.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  26.54 
 
 
383 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  29.57 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  24.23 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  27.54 
 
 
418 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  28.06 
 
 
391 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  30.92 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  28.01 
 
 
396 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  27.98 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  27.79 
 
 
412 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  26.96 
 
 
401 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  25.54 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  26.06 
 
 
381 aa  96.7  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.49 
 
 
400 aa  96.3  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  32.72 
 
 
391 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  29.25 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  31.78 
 
 
402 aa  96.3  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  29.74 
 
 
443 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  25.61 
 
 
404 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  27.27 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.52 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1654  ROK  27.87 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  26.22 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.76 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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