More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0125 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  97.11 
 
 		 415 aa  792    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  100 
 
 		 415 aa  834    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  69.93 
 
 		 409 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  72.36 
 
 		 409 aa  581  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  56.22 
 
 		 439 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  54.23 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  45.39 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  48.95 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 407 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  51.05 
 
 		 407 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  49.36 
 
 		 410 aa  355  7.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  50 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  43.12 
 
 		 398 aa  312  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  40.97 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  38.79 
 
 		 404 aa  289  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  37.63 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  38.66 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  37.5 
 
 		 414 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  37.03 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  41.45 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  37.06 
 
 		 410 aa  260  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  38.4 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  38.1 
 
 		 408 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  37.72 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  35.16 
 
 		 410 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  33.33 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  33.67 
 
 		 415 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  33.42 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  33.42 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  33.09 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  32.85 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  33.01 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  31.81 
 
 		 416 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  31.81 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  31.81 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  31.28 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  31.5 
 
 		 416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.3 
 
 		 417 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  28.43 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  31.28 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.12 
 
 		 391 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  29.77 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  29.24 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  30.26 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  28.82 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  29.34 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.43 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  28.93 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  28.32 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.42 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.24 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  28.53 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  31.8 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  29.12 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  26.65 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  26.68 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  30.33 
 
 		 754 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  25.61 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  25.61 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  25.4 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  25.46 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.43 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  26.98 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.3 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  33.07 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  26.4 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  28.03 
 
 		 429 aa  96.3  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  29.39 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  27.78 
 
 		 421 aa  93.2  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  29.91 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.92 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  25.27 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  27.24 
 
 		 396 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  29.8 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.71 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  27.34 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  26.77 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.83 
 
 		 425 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  30.43 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  26.45 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.16 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  25.38 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.23 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  27.53 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  27.14 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  26.94 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.64 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.85 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  25.58 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  24.43 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.53 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.99 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  30.42 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  26.48 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  30.4 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
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NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  24.87 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  24.73 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004311  BRA1189  ROK family protein  26.64 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  26.37 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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