More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 429 aa  823    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  61.58 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  56.82 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  48.21 
 
 		 414 aa  329  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  53.85 
 
 		 402 aa  319  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  49.07 
 
 		 421 aa  305  8.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  41.71 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  39.59 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.25 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.92 
 
 		 391 aa  177  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  40.16 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  35.05 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  34.28 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.18 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.22 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  35.05 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  35.59 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  31.23 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.44 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.68 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.89 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  34.29 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  35.47 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.67 
 
 		 401 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.57 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  32.76 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.35 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  35.75 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.49 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  34.47 
 
 		 400 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  31.36 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.65 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.9 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.74 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.89 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  31.68 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  33.15 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  34.02 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.03 
 
 		 503 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.96 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  31.32 
 
 		 425 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.49 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  31.61 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.49 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.29 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  31.76 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  30.86 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  32.21 
 
 		 417 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.25 
 
 		 386 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  34.38 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  30 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  27.89 
 
 		 754 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.31 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  32.68 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  31.36 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  33.91 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.22 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.77 
 
 		 347 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  40 
 
 		 350 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.23 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.65 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.73 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.2 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.72 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  31.95 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.55 
 
 		 383 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  32.88 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  29.5 
 
 		 395 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.03 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  31.2 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.39 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  32.6 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.94 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  29.29 
 
 		 378 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  25.65 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.42 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.69 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  25.14 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  25.14 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01300  transcriptional regulator/sugar kinase  31.67 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  28.3 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  25.24 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  29.95 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  34.73 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  35.82 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  24.18 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  31.07 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  28.13 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  24.86 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  25.26 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  36.59 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  28.46 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  32.63 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  29.04 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.19 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  37.22 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.22 
 
 		 315 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  32.2 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>