More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0043 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  100 
 
 
421 aa  812    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  50 
 
 
425 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  51.13 
 
 
414 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  49.53 
 
 
429 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  53.47 
 
 
417 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  51.23 
 
 
402 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  40.62 
 
 
417 aa  250  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  40.21 
 
 
417 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.59 
 
 
408 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.88 
 
 
408 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  34.41 
 
 
403 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.95 
 
 
405 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.9 
 
 
396 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  33.99 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  31.14 
 
 
404 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.66 
 
 
396 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.23 
 
 
399 aa  143  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.47 
 
 
410 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  36.67 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.99 
 
 
414 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.68 
 
 
399 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  29.64 
 
 
435 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.29 
 
 
391 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.26 
 
 
406 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  30.24 
 
 
424 aa  136  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.32 
 
 
397 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  30.98 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.88 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  32.17 
 
 
435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  34.67 
 
 
350 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  33.62 
 
 
403 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.79 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  33.76 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  30.67 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  30.3 
 
 
754 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  30.37 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.74 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  27.15 
 
 
372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.18 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  30.77 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.59 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01300  transcriptional regulator/sugar kinase  31.62 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.91 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  26.15 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  28.52 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  31.78 
 
 
393 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.99 
 
 
400 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.55 
 
 
400 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  25.13 
 
 
404 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.59 
 
 
503 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  25.27 
 
 
405 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  30.33 
 
 
425 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.97 
 
 
322 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  31.94 
 
 
407 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  31.87 
 
 
417 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  27.61 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  27.61 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  27.61 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  27.61 
 
 
406 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  27.61 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  27.61 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.61 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.61 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  27.61 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  31.96 
 
 
395 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30.33 
 
 
425 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.36 
 
 
398 aa  123  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  27.64 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  28.75 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  25.57 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  27.64 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27.64 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  27.64 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.79 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  27.64 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  26.13 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  24.53 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  24.53 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  26.98 
 
 
389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.92 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.99 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.71 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  24.53 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.25 
 
 
315 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.25 
 
 
315 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  24.53 
 
 
406 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  30.75 
 
 
384 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  25.33 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  25.33 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  24.67 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  24.53 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  24.53 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  24.53 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  24.53 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  24.53 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  26.92 
 
 
406 aa  120  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  29.5 
 
 
414 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  30.52 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  32.48 
 
 
404 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  25.33 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>