More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3539 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  100 
 
 
395 aa  781    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  70.03 
 
 
397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  51.84 
 
 
435 aa  359  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  48.72 
 
 
405 aa  315  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  47.33 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  44.22 
 
 
404 aa  298  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  41.96 
 
 
402 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  39.1 
 
 
410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  37.37 
 
 
396 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31.82 
 
 
396 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30 
 
 
399 aa  186  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  33.51 
 
 
395 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.55 
 
 
408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.12 
 
 
396 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.64 
 
 
409 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.44 
 
 
383 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  31.41 
 
 
400 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  30.77 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  35.71 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.5 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.83 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  31.13 
 
 
397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.76 
 
 
398 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  32.28 
 
 
417 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.68 
 
 
391 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  30.79 
 
 
404 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  32.13 
 
 
414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  31.39 
 
 
428 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  33.94 
 
 
390 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  33.59 
 
 
448 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.14 
 
 
408 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  34.73 
 
 
401 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.51 
 
 
405 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  32.66 
 
 
429 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  31.03 
 
 
417 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.3 
 
 
378 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  28.94 
 
 
406 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  34 
 
 
387 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  33.84 
 
 
397 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.25 
 
 
429 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.96 
 
 
435 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.01 
 
 
418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  29.17 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.76 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.58 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.83 
 
 
400 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  35.34 
 
 
404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30.7 
 
 
425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  30.06 
 
 
425 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.63 
 
 
425 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  32.4 
 
 
395 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  24.87 
 
 
385 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  33.12 
 
 
374 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.59 
 
 
389 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.11 
 
 
392 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.37 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  28.1 
 
 
364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  33.53 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  31.62 
 
 
425 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  33.42 
 
 
393 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.57 
 
 
410 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  31.75 
 
 
396 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  25.13 
 
 
372 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  26.41 
 
 
381 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  35.29 
 
 
390 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.1 
 
 
408 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32.32 
 
 
422 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  33.25 
 
 
391 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  22.67 
 
 
408 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  30.15 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  30.37 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.75 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  32.49 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.83 
 
 
503 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  32.36 
 
 
396 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.38 
 
 
390 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.73 
 
 
396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  32.34 
 
 
390 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.94 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  25.88 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  32.33 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  33.15 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  25.61 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  29.47 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.65 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  33.07 
 
 
418 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.33 
 
 
406 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  34.73 
 
 
401 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  29.55 
 
 
389 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
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NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  29.97 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  36.33 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
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NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.2 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  25.43 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  30.67 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  33.52 
 
 
407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
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NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  29.3 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.03 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.87 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  32.34 
 
 
372 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
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NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  24.94 
 
 
374 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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