More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0169 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  100 
 
 
397 aa  795    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  47.81 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  34 
 
 
409 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.95 
 
 
401 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  33.68 
 
 
391 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.55 
 
 
395 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.97 
 
 
383 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.87 
 
 
404 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.55 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.65 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.79 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  33.51 
 
 
416 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.81 
 
 
391 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.94 
 
 
397 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.53 
 
 
393 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.67 
 
 
387 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.55 
 
 
408 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.84 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.21 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.87 
 
 
381 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.68 
 
 
399 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  31.36 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  29.16 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.43 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  35.15 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  27.03 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  26.79 
 
 
378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  34.85 
 
 
400 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  29.27 
 
 
503 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.98 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  25.89 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  33.84 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.37 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  30.45 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  29.62 
 
 
418 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29 
 
 
422 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.49 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.76 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  33.59 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.24 
 
 
401 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.61 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.25 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.25 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  30.73 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  26.67 
 
 
404 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  29.11 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.46 
 
 
402 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  31.22 
 
 
414 aa  126  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  32.27 
 
 
382 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  32.34 
 
 
417 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  28.16 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  26.72 
 
 
379 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.05 
 
 
389 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  31.03 
 
 
404 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  28.39 
 
 
404 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.38 
 
 
402 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  36.3 
 
 
473 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  30.83 
 
 
402 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.15 
 
 
392 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  31.43 
 
 
391 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.15 
 
 
403 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  30.39 
 
 
397 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  30.05 
 
 
417 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.37 
 
 
405 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  31.23 
 
 
420 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  30.82 
 
 
391 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  31.2 
 
 
399 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.87 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.21 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1271  ROK family protein  31.98 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0499308  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  30.79 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  27.93 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  32 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  28.76 
 
 
408 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  30.43 
 
 
403 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.02 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.29 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  26.41 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.53 
 
 
406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.53 
 
 
406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.53 
 
 
406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.53 
 
 
406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.53 
 
 
406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  31.75 
 
 
367 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  26.91 
 
 
398 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  33.63 
 
 
396 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.58 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  27.5 
 
 
395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  25.77 
 
 
404 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  26.49 
 
 
395 aa  116  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  26.23 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25.77 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25.77 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25.77 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25.77 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
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NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.35 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25.77 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25.77 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25.77 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25.77 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
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