More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0267 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  100 
 
 
414 aa  801    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  46.08 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  48.21 
 
 
429 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  49 
 
 
417 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  51.13 
 
 
421 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  49.75 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  36.34 
 
 
417 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  35.4 
 
 
417 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.8 
 
 
408 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  29.56 
 
 
399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.85 
 
 
395 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  31.92 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  32.21 
 
 
503 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  37.64 
 
 
391 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.61 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.35 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  31.68 
 
 
393 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.28 
 
 
410 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.83 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  30.75 
 
 
389 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  28.24 
 
 
400 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.97 
 
 
414 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.82 
 
 
396 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.17 
 
 
397 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  34.11 
 
 
404 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.74 
 
 
401 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.09 
 
 
396 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.05 
 
 
409 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  31.83 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  30.1 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.87 
 
 
406 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.68 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  31.47 
 
 
403 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  34 
 
 
417 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  31.01 
 
 
372 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  30.61 
 
 
754 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  29.56 
 
 
427 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.2 
 
 
397 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.12 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  31.34 
 
 
395 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  29.79 
 
 
407 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.53 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.93 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.22 
 
 
410 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  30.36 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  27.47 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  33.97 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27.89 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.61 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.29 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  31.6 
 
 
435 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.83 
 
 
405 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.56 
 
 
408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.78 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.16 
 
 
313 aa  130  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  31.99 
 
 
409 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  30.87 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  29.52 
 
 
407 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.76 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.85 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25.87 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  29.94 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  35.36 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.13 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  26.84 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  26.84 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  26.84 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.87 
 
 
396 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  29.71 
 
 
404 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.41 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  27.96 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  33.6 
 
 
403 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30 
 
 
435 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  34.62 
 
 
400 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  31.22 
 
 
397 aa  126  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.74 
 
 
434 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  27.85 
 
 
406 aa  126  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  25.07 
 
 
364 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  31.67 
 
 
418 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.08 
 
 
395 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  32.47 
 
 
402 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.2 
 
 
405 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.14 
 
 
386 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.57 
 
 
395 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  30.26 
 
 
379 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  33.16 
 
 
390 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
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NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  31.18 
 
 
390 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  30.72 
 
 
425 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  27.69 
 
 
407 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  34.12 
 
 
427 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  23.31 
 
 
388 aa  123  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  24.04 
 
 
404 aa  122  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  25.33 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  25.33 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  25.33 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  25.33 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  25.33 
 
 
406 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.86 
 
 
395 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30.42 
 
 
425 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  25.33 
 
 
406 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
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