More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3061 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  100 
 
 
407 aa  782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  40.1 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  37.83 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1715  ROK family protein  34.99 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.853629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  33.67 
 
 
422 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  35.31 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  33.95 
 
 
395 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  34.86 
 
 
392 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  33.16 
 
 
393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  34.99 
 
 
396 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.25 
 
 
398 aa  143  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.8 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05680  transcriptional regulator/sugar kinase  31.9 
 
 
399 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.244625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  32.98 
 
 
404 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  31.52 
 
 
395 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.98 
 
 
389 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.47 
 
 
383 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  34.08 
 
 
448 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  32.47 
 
 
396 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.13 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  33.51 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  31.02 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  32.2 
 
 
418 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  36.49 
 
 
391 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  32.82 
 
 
396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  33.43 
 
 
403 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.53 
 
 
399 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  34.3 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.06 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  32.27 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  31.17 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.06 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  30.75 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  32.57 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  28.24 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.43 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.53 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.44 
 
 
405 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  30.92 
 
 
410 aa  126  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  24.94 
 
 
434 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  30.85 
 
 
403 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  32.36 
 
 
417 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  23.82 
 
 
408 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.77 
 
 
390 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  24.75 
 
 
405 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.57 
 
 
428 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  28.85 
 
 
400 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.79 
 
 
386 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  33.9 
 
 
390 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.43 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.42 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.33 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.99 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  33.51 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  34.79 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.69 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  27.01 
 
 
406 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  27.01 
 
 
406 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  27.01 
 
 
406 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  23.58 
 
 
404 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  27.01 
 
 
406 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.01 
 
 
406 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  24.43 
 
 
416 aa  121  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.01 
 
 
406 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  27.01 
 
 
406 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  25.26 
 
 
406 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  27.01 
 
 
406 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  27.01 
 
 
406 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.05 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  25.13 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  26.68 
 
 
407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  25.13 
 
 
408 aa  120  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  25.13 
 
 
408 aa  120  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.02 
 
 
410 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  33.52 
 
 
434 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  24.93 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.92 
 
 
425 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  24.93 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  24.93 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  24.93 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  26.01 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  24.93 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  32.73 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  32.24 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  32.33 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  24.93 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  28.13 
 
 
402 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  24.93 
 
 
406 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  25.41 
 
 
404 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  24.93 
 
 
406 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  30.3 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.94 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  24.93 
 
 
406 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.1 
 
 
406 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  25.34 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  30.55 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  24.1 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.1 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  26.88 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.56 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>