More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3852 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  100 
 
 
390 aa  763    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  48.19 
 
 
402 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  48.84 
 
 
395 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  47.55 
 
 
410 aa  318  9e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  49.34 
 
 
392 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  48.68 
 
 
395 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  48.95 
 
 
503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  47.16 
 
 
406 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  46.67 
 
 
443 aa  296  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  48.83 
 
 
405 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  44.82 
 
 
427 aa  290  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  46.56 
 
 
403 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  43.23 
 
 
420 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  42.93 
 
 
395 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  42.12 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  45 
 
 
409 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  40.85 
 
 
389 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  45.45 
 
 
372 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  44.69 
 
 
393 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  45.68 
 
 
392 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  47.3 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  42.86 
 
 
392 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  37.36 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  38.44 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  38.01 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  41.21 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  35.49 
 
 
395 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  37.88 
 
 
401 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.95 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  35.46 
 
 
384 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  37.67 
 
 
408 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  39.51 
 
 
404 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.2 
 
 
391 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  36.32 
 
 
394 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  36.08 
 
 
381 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  36.99 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  35.99 
 
 
402 aa  173  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  33.59 
 
 
455 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.26 
 
 
395 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  34.59 
 
 
381 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  37.57 
 
 
387 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.38 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  36.16 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32.38 
 
 
396 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  33.85 
 
 
396 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  34.54 
 
 
406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  34.93 
 
 
429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  35.65 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  37.11 
 
 
397 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.49 
 
 
408 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.7 
 
 
396 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.01 
 
 
409 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.02 
 
 
399 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  33.67 
 
 
429 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.9 
 
 
425 aa  150  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.46 
 
 
402 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.41 
 
 
321 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  30.41 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.87 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.23 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  34.97 
 
 
393 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  33.85 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  35.78 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.48 
 
 
315 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.48 
 
 
315 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32.17 
 
 
422 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.88 
 
 
321 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  30.03 
 
 
399 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  28.39 
 
 
400 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.29 
 
 
398 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.04 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  31.01 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  31.16 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  34.36 
 
 
418 aa  141  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.43 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.93 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  31.56 
 
 
404 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.1 
 
 
405 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.63 
 
 
408 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.66 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  32.98 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  32.14 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.37 
 
 
383 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.51 
 
 
400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.49 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  33.05 
 
 
417 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  33.33 
 
 
414 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  33.94 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.6 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
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NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.59 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.91 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.83 
 
 
386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  32.95 
 
 
448 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
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NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.99 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.47 
 
 
347 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  33.33 
 
 
420 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
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NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.21 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
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NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.06 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.14 
 
 
406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
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