More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01300 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01300  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 435 aa  851    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  31.37 
 
 		 417 aa  136  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.67 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  32.65 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.32 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  27.46 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  31.73 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.74 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.09 
 
 		 417 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.02 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.04 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  31.21 
 
 		 421 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.07 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.69 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.79 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.16 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  25.06 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.07 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.44 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  25.07 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.12 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  23.42 
 
 		 381 aa  93.2  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  34.53 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  26.36 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  23.43 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  29.02 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  24.52 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  21.87 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  21.88 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.28 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
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NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  26.96 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  31.54 
 
 		 473 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  19.94 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  22.16 
 
 		 388 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.03 
 
 		 397 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  23.48 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  27.34 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.95 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  22.71 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  23.11 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  24.57 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  22.71 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  29.5 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.1 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  29.68 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.36 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  22.71 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  21.86 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  23.59 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  26.63 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  21.49 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  28.79 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
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NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  27.68 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.38 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  30.59 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.8 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  20.94 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  21.76 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
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NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  32.32 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  24.25 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  26.99 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.24 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  23.76 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  27.1 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  22.86 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  25.58 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  30.47 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  20.9 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  24.68 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  24.87 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  26.05 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  27.07 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  25.71 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  24.53 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  22.6 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  25.77 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  22.25 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  22.82 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  21.83 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  20.97 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  20.97 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  25.71 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  20.97 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  20.97 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  20.97 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  23.68 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  30.38 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  23.37 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  23.18 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  31.44 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  28.93 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  28.03 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  27.14 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  24.94 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  27.82 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  26.22 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  29.15 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  28.94 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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