More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1677 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  100 
 
 		 435 aa  827    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  53.94 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  52.96 
 
 		 395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  50.86 
 
 		 405 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  47.65 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  44.44 
 
 		 404 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  43.38 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  37.44 
 
 		 396 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  37.53 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30.37 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.28 
 
 		 408 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.71 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.54 
 
 		 410 aa  156  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  33.9 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.49 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.18 
 
 		 395 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  32.67 
 
 		 405 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.65 
 
 		 378 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  33.87 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.93 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.1 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.59 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.39 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  31.6 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.5 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  33.16 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  32.01 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.83 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.82 
 
 		 400 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.33 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.92 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  23.59 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.37 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  34.1 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  29.19 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  24.02 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  24.34 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.39 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.16 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  33.58 
 
 		 387 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  27.16 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  31.01 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.51 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  34.56 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  25.31 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.98 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.32 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  32.38 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.01 
 
 		 312 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  22.96 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  29.3 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.02 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.57 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  33.68 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  26.39 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  30.48 
 
 		 448 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 405 aa  123  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.4 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.25 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.25 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.51 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.36 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.58 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  33.43 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.62 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  31.61 
 
 		 374 aa  121  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33.08 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.84 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  28.71 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  25.75 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.42 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  33.01 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  24.7 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  33.51 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.67 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  31.49 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  32.27 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.51 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  33.08 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.16 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.36 
 
 		 322 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25.68 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25.68 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25.68 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25.68 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.12 
 
 		 408 aa  117  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.77 
 
 		 410 aa  117  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  30.61 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25.68 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  25.68 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25.68 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25.68 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25.68 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.41 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.92 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  33.5 
 
 		 389 aa  116  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  20.75 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  27.49 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  26.63 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>