More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2486 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  100 
 
 
417 aa  848    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  40.46 
 
 
391 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  38.05 
 
 
400 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  38.3 
 
 
400 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  37.34 
 
 
379 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  39.64 
 
 
389 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  35.26 
 
 
417 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  34.7 
 
 
409 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  35.11 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  33.82 
 
 
418 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  33.42 
 
 
401 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  31.58 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  31.52 
 
 
421 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.97 
 
 
410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.15 
 
 
408 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  34.53 
 
 
417 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  29.92 
 
 
415 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.36 
 
 
391 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  29.67 
 
 
415 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  29.67 
 
 
415 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  32.96 
 
 
402 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  29.41 
 
 
415 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  29.67 
 
 
415 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.45 
 
 
400 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.06 
 
 
409 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  29.16 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.61 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  31.83 
 
 
399 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.57 
 
 
396 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  32.17 
 
 
412 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  28.44 
 
 
381 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  29.34 
 
 
416 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  29.73 
 
 
376 aa  150  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.43 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  29.69 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  29.69 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.45 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  28.93 
 
 
416 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  32.8 
 
 
425 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.79 
 
 
401 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  29.19 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  29.19 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.03 
 
 
414 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  29.26 
 
 
410 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  31.75 
 
 
412 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  31.19 
 
 
398 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  33.43 
 
 
427 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.65 
 
 
422 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.64 
 
 
429 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  32.34 
 
 
397 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  33.92 
 
 
412 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  33.72 
 
 
390 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  28.5 
 
 
410 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.86 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  30.29 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  29.58 
 
 
376 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.3 
 
 
403 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.69 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  28.5 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.73 
 
 
405 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.06 
 
 
389 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  29.02 
 
 
503 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.55 
 
 
404 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  28.64 
 
 
378 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  29.82 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.51 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  28.97 
 
 
416 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  28.61 
 
 
382 aa  136  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  29.15 
 
 
390 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  27.34 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.06 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.23 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  29.07 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  31.03 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.15 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.55 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.93 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.13 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  31.09 
 
 
390 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.69 
 
 
434 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.59 
 
 
405 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  26.98 
 
 
409 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  28.24 
 
 
415 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  28.34 
 
 
374 aa  133  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1654  ROK  29.72 
 
 
420 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  30.03 
 
 
379 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.925334 
 
 
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NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.75 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.7 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.08 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
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NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  31.15 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.93 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  27.1 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  31.15 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_004311  BRA1189  ROK family protein  32.41 
 
 
374 aa  131  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  28.28 
 
 
439 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.97 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  28.49 
 
 
417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  28.43 
 
 
435 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.47 
 
 
405 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  29.51 
 
 
429 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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