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for query gene Achl_2133 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  81.49 
 
 
417 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  100 
 
 
417 aa  827    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  41.71 
 
 
429 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  37.85 
 
 
425 aa  256  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  36.34 
 
 
414 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  41.58 
 
 
427 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  35.92 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  40.62 
 
 
421 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  37.4 
 
 
417 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  35 
 
 
754 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  31.46 
 
 
424 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  39.65 
 
 
382 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6189  ROK family protein  38.21 
 
 
402 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  30.77 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30.37 
 
 
399 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  31.08 
 
 
417 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  30.92 
 
 
391 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.29 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  31.76 
 
 
400 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  35.88 
 
 
379 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  33.96 
 
 
390 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.09 
 
 
410 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.88 
 
 
389 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  30.79 
 
 
400 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  35.88 
 
 
350 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.26 
 
 
414 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  37.6 
 
 
409 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  29.41 
 
 
372 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.4 
 
 
391 aa  150  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.38 
 
 
408 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.5 
 
 
400 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.61 
 
 
503 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.85 
 
 
403 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  26.46 
 
 
406 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  31.12 
 
 
401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30.69 
 
 
408 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  32.28 
 
 
395 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  29.95 
 
 
401 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.97 
 
 
410 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.23 
 
 
389 aa  142  8e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.01 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  31.02 
 
 
397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  30.18 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.09 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.78 
 
 
402 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  30.79 
 
 
389 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.28 
 
 
418 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.98 
 
 
410 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  33.01 
 
 
390 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.21 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  30.63 
 
 
386 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.66 
 
 
386 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.79 
 
 
387 aa  136  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.59 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.95 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  32.01 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  27.4 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  30 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.95 
 
 
378 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  31.92 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.87 
 
 
396 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.16 
 
 
315 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.99 
 
 
392 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  28.04 
 
 
396 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  28.49 
 
 
404 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.21 
 
 
405 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  34.29 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  23.92 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  26.74 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.34 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.61 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  27.82 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  27.82 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.56 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  28.61 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  31.3 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.69 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  30.56 
 
 
418 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  28.17 
 
 
417 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  27.46 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.43 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  35.17 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
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NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  29.19 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.13 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  28.04 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  29.19 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.72 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_08010  transcriptional regulator/sugar kinase  32.73 
 
 
368 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.43 
 
 
396 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  28.39 
 
 
409 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  29.02 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  27.83 
 
 
327 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.9 
 
 
425 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  28.24 
 
 
402 aa  127  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
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