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for query gene Caci_2150 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  100 
 
 
395 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  41.97 
 
 
401 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  43.19 
 
 
404 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  39.63 
 
 
387 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  37.98 
 
 
400 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  38.46 
 
 
401 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  39.13 
 
 
389 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  38.2 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  35.19 
 
 
396 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  35.48 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  36.01 
 
 
396 aa  210  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  35.9 
 
 
397 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  34.62 
 
 
402 aa  209  9e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  35.52 
 
 
429 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  37.67 
 
 
418 aa  199  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  36.6 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  35.28 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  33.51 
 
 
391 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  37.74 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.42 
 
 
418 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  30.52 
 
 
389 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  33.97 
 
 
408 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  34.85 
 
 
410 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.37 
 
 
397 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.57 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.79 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  34.32 
 
 
406 aa  170  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  29.87 
 
 
399 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.7 
 
 
383 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  30.54 
 
 
395 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.24 
 
 
409 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  36 
 
 
379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.27 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  34.75 
 
 
407 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.01 
 
 
396 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  35.83 
 
 
390 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.91 
 
 
503 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  33.24 
 
 
392 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  31.83 
 
 
393 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  32.29 
 
 
404 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.91 
 
 
400 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.38 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  32.82 
 
 
410 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  32.1 
 
 
402 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.21 
 
 
399 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  28.3 
 
 
402 aa  150  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.94 
 
 
391 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.35 
 
 
414 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  30.36 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.74 
 
 
428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  30.56 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  33.24 
 
 
434 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  32.71 
 
 
395 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  30 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  25.21 
 
 
364 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.57 
 
 
408 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  32.43 
 
 
403 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.28 
 
 
396 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  29.67 
 
 
402 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  32.9 
 
 
443 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.03 
 
 
398 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  30.54 
 
 
389 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.67 
 
 
405 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  31.25 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  25.4 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  34.64 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30.23 
 
 
417 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.29 
 
 
403 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  31.09 
 
 
395 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.79 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  29.2 
 
 
435 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  30.63 
 
 
404 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  29.68 
 
 
389 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  25.4 
 
 
408 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.98 
 
 
408 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  31.15 
 
 
390 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.46 
 
 
385 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  30.3 
 
 
448 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.97 
 
 
417 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  26.06 
 
 
404 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  31.11 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  30.9 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  24.22 
 
 
404 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  30.82 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  31.08 
 
 
405 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  32.69 
 
 
393 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  24.94 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  28.87 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  32.67 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  28.28 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
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NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  30.27 
 
 
392 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.03 
 
 
399 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.92 
 
 
405 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  29.16 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.75 
 
 
397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
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