More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1809 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  100 
 
 		 396 aa  801    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.95 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  32.38 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  32.12 
 
 		 379 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.42 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  32.24 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  35.84 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  34.24 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  31.8 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.69 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.28 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  27.86 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  28.21 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.24 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0976  ROK family protein  34.23 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  28.95 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  33.87 
 
 		 397 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.47 
 
 		 408 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0694  ROK family protein  30.08 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0957  ROK family protein  34.33 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  25.94 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.55 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.32 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  29.69 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  28.17 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  24.68 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  30.21 
 
 		 397 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  30.45 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.02 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  29.63 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.67 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  27.89 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  25.89 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.39 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  28.28 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  26.61 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.98 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  26.02 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  29.23 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  24.6 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.43 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  28.12 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  29.07 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.36 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  29.48 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  27.1 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.88 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.65 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  28.1 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  27.23 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.64 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  27.6 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.68 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.52 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  27.84 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.36 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  25.96 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  27.65 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.94 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.11 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  28.48 
 
 		 374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.32 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  32.2 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29.43 
 
 		 401 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.4 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.4 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  27.63 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  28.16 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  26.83 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  25.67 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  25.27 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  26.54 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  26.9 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  26.52 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  26.68 
 
 		 406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.3 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  25.57 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.67 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  26.55 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  25.88 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  29.25 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
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NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  26.18 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.12 
 
 		 503 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  25.2 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.08 
 
 		 352 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  27.85 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.9 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  26.1 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  30.77 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  25.44 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  26.97 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  27.46 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  28.66 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
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NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  25.47 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
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NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  28.65 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  25.72 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  30.95 
 
 		 416 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  26.33 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.68 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  23.14 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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