More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0258 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  84.48 
 
 
410 aa  673    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  100 
 
 
406 aa  795    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  64.12 
 
 
395 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  63.66 
 
 
392 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  60.53 
 
 
503 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  58.53 
 
 
405 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  54.33 
 
 
395 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  58.84 
 
 
403 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  50.13 
 
 
402 aa  348  8e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  44.25 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  47.49 
 
 
390 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  42.89 
 
 
420 aa  289  7e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  41.92 
 
 
395 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  43.56 
 
 
443 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  47.84 
 
 
392 aa  282  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  42.19 
 
 
427 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  41.78 
 
 
405 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  39.21 
 
 
395 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  43.52 
 
 
409 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  43.75 
 
 
372 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  39.14 
 
 
389 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  43.5 
 
 
393 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  42.31 
 
 
392 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  37.34 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  37.34 
 
 
392 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  35.73 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  42.09 
 
 
389 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  35.17 
 
 
384 aa  210  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  35.62 
 
 
381 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  37.27 
 
 
394 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  35.07 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  35.68 
 
 
406 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  38.66 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  35.86 
 
 
397 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  37.5 
 
 
387 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  35.56 
 
 
408 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  37.06 
 
 
429 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  33.42 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.96 
 
 
391 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  35.71 
 
 
389 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  35.64 
 
 
404 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  35.28 
 
 
422 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  33.42 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  34.49 
 
 
401 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.89 
 
 
395 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  35.85 
 
 
401 aa  170  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  33.93 
 
 
429 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  34.76 
 
 
402 aa  167  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  31.52 
 
 
396 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  31.65 
 
 
396 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  34.05 
 
 
395 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.49 
 
 
398 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  33.15 
 
 
393 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.75 
 
 
409 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  27.57 
 
 
405 aa  156  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.54 
 
 
408 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.85 
 
 
399 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.33 
 
 
383 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.84 
 
 
397 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  29.34 
 
 
455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.29 
 
 
418 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.37 
 
 
410 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1908  ROK family protein  31.75 
 
 
391 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.477922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  33.71 
 
 
420 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.15 
 
 
404 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  29.87 
 
 
396 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31.15 
 
 
396 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.47 
 
 
396 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.68 
 
 
399 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  32.86 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.27 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  26.12 
 
 
408 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.26 
 
 
315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.26 
 
 
315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  32.07 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  31.06 
 
 
428 aa  146  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.12 
 
 
396 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.38 
 
 
405 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  32.29 
 
 
418 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.34 
 
 
402 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  26.58 
 
 
416 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.99 
 
 
399 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.02 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  29.87 
 
 
414 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.39 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.1 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.37 
 
 
389 aa  139  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.63 
 
 
429 aa  140  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.25 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.08 
 
 
388 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  33.76 
 
 
319 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.85 
 
 
405 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.32 
 
 
364 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.18 
 
 
321 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.79 
 
 
385 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  31.51 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  33.15 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.82 
 
 
393 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.95 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.59 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>