More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5104 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  100 
 
 		 404 aa  793    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  52.24 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  46.73 
 
 		 397 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  43.7 
 
 		 435 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  44.22 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  44.3 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  46.08 
 
 		 405 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  34.55 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  33.75 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.11 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  29.75 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.27 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.42 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.2 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.66 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.85 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  33.16 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.34 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.64 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.78 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  25.64 
 
 		 381 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  32.29 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  32.81 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.32 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  24.74 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.8 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  26.88 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.66 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.15 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.25 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.26 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.46 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.74 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  29.26 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  32.97 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.56 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.98 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  30.61 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  29.71 
 
 		 414 aa  136  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  30.57 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.3 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.32 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30.57 
 
 		 425 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.3 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.77 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  31.49 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  23.97 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.43 
 
 		 312 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  32.33 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.95 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  22.92 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  25 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  24.8 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  27.75 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  23.51 
 
 		 408 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  29.26 
 
 		 443 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  30.03 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  31.22 
 
 		 420 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  26.61 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.43 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.77 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  34.6 
 
 		 321 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  28.93 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  33.02 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.31 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.48 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.08 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.38 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.58 
 
 		 315 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.59 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  23.45 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  29.15 
 
 		 435 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  24.81 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.87 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  27.75 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  28.85 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.21 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  29.12 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  26.91 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  32.32 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.82 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.25 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  24.2 
 
 		 404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  27.6 
 
 		 395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30.26 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  27.93 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.7 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.65 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25.66 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  26.88 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  27.58 
 
 		 417 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  26.88 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.81 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  31.44 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  26.88 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  26.88 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  26.88 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  32.04 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>