More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6967 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  100 
 
 
401 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  43.68 
 
 
390 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  32.31 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  34.68 
 
 
386 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  32.61 
 
 
400 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  36.41 
 
 
404 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  30.57 
 
 
391 aa  189  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  32.46 
 
 
428 aa  186  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30.67 
 
 
435 aa  186  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  30.87 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  33.42 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.92 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  34.11 
 
 
425 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  34.4 
 
 
425 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  34.23 
 
 
395 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  36.13 
 
 
390 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  33.02 
 
 
409 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2815  ROK family protein  38.36 
 
 
389 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231049  normal  0.37172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  33.92 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  38.48 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  31.75 
 
 
405 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  35.14 
 
 
425 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  31.48 
 
 
434 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.46 
 
 
396 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  32.66 
 
 
386 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  33.6 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  35.73 
 
 
397 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  26.25 
 
 
385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  33.06 
 
 
404 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  32.6 
 
 
417 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  32.87 
 
 
405 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  30.68 
 
 
404 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.97 
 
 
389 aa  160  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  30.18 
 
 
405 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.56 
 
 
418 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.54 
 
 
398 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.22 
 
 
322 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.89 
 
 
396 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  31.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  31.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  31.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  31.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.81 
 
 
405 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  32.88 
 
 
407 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.31 
 
 
397 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.94 
 
 
401 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  31.65 
 
 
402 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  28.77 
 
 
404 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  31.51 
 
 
406 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  28.61 
 
 
404 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  32.35 
 
 
408 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  33.42 
 
 
393 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  33.24 
 
 
390 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  31.51 
 
 
406 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  26.73 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  31.28 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  36.54 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.26 
 
 
389 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  29.75 
 
 
406 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  34.69 
 
 
403 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  34.57 
 
 
395 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  28.05 
 
 
404 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  31.58 
 
 
414 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  30.17 
 
 
407 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  32.21 
 
 
393 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  29.63 
 
 
408 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  29.63 
 
 
408 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  29.63 
 
 
408 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  30.79 
 
 
396 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  28.82 
 
 
404 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.81 
 
 
402 aa  149  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  33.53 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  31.72 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  31.34 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  33.77 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  34.66 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  33.24 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  34.53 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  36.29 
 
 
347 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  34.06 
 
 
395 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.72 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  29.31 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  31.99 
 
 
417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  29.43 
 
 
401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.03 
 
 
399 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  30.21 
 
 
372 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2213  ROK family protein  32.37 
 
 
423 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.915289  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.53 
 
 
364 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  34.15 
 
 
400 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  33.75 
 
 
386 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.04 
 
 
406 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>