More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7617 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  100 
 
 		 408 aa  801    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  67.85 
 
 		 413 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  64.23 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  66.41 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  57.14 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  56.63 
 
 		 393 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  50.74 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  45.1 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  42.07 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  41.37 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1123  ROK family protein  59.05 
 
 		 836 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210366  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  38.66 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  40.51 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  35.61 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  38.56 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.68 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  35.75 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.49 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  34.73 
 
 		 457 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.38 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  33.78 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  33.75 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  31.38 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  29.21 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.52 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  33.85 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  31.34 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  33.06 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.2 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.44 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  32.32 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  26.21 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  29.01 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 434 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  31.65 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.38 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  34.78 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.53 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  27.39 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.82 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  27.62 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  27.98 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  34.74 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  36.86 
 
 		 473 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  26.87 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.44 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  28.93 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  32.16 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  26.85 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.22 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.67 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  33.25 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.2 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  26.92 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.92 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  26.93 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  26.93 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  32.06 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.64 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  24.87 
 
 		 378 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.27 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  31.27 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.66 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.27 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  32.32 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  32.56 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  24.43 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.06 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  26.89 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  34.91 
 
 		 321 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  24.48 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  26.72 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.46 
 
 		 408 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  33.07 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  25.81 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  27.81 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.18 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.46 
 
 		 422 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  24.8 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  30.09 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  26.28 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  26.28 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.72 
 
 		 352 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  26.28 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  39.34 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  26.28 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.74 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  26.28 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  26.28 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.88 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  26.28 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  33.08 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  26.28 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  31.61 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  26.28 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.77 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.99 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.57 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>