More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5946 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  100 
 
 		 422 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  52.59 
 
 		 401 aa  358  8e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  53.27 
 
 		 413 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  54.02 
 
 		 408 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  51.39 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  52.39 
 
 		 393 aa  342  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  50.99 
 
 		 408 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  43.5 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  43.94 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  41.46 
 
 		 389 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  41.94 
 
 		 390 aa  239  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  38.73 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  42.72 
 
 		 418 aa  209  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1123  ROK family protein  50.22 
 
 		 836 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210366  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  33.49 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  34.68 
 
 		 457 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  34.24 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  34.47 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  35.18 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.28 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  35.33 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.93 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  32.26 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  30.47 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.29 
 
 		 395 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  30.05 
 
 		 417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  27.82 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  32.85 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  31.37 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  31.51 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.19 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  38.21 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  28.61 
 
 		 409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  33.43 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  31.01 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.22 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.34 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.18 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  35.44 
 
 		 473 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.68 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  26.54 
 
 		 410 aa  131  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25.54 
 
 		 404 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  29.17 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  28.1 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.88 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  32.05 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.02 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.74 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  30.29 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.81 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.65 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.69 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 404 aa  126  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.95 
 
 		 395 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.21 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.15 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.02 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.11 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.35 
 
 		 397 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  31.7 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.41 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.68 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  24.49 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.04 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  24.94 
 
 		 408 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.92 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  28.96 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  24.94 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.13 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  24.94 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  26.95 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.14 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  26.08 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.68 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.01 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  25 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  25.13 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  29.88 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  30.22 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  33.64 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.65 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  25.4 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  25.4 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  25.4 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  28.29 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  25.4 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  25.4 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  23.9 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  30.33 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
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NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.75 
 
 		 405 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.03 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.98 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.43 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  24.6 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  31.75 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  28.93 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
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NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  33.08 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  24.62 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  28.9 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
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